食肉目动物鲜味受体基因(Taslrl)的分子进化研究

来源 :四川农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:liuguoqiangswu
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味觉在动物的采食中起着很重要的作用,尤其是鲜味在食肉目动物中的食物选择中更是担着主要角色,因为它们中许多以肉类为主要食物。食肉目动物从食性上可以分为三大类,包括肉食类(meat-eater),杂食类(omnivores)和植食类(plant-eater)的。食肉目动物无疑成为研究物种食性多样化和味觉基因关系的首选动物,目前国内外关于食肉目的地理分布和化石研究较多,然而以鲜味受体(Taslr1)基因作为分子标记,来研究食肉目群体的进化以及食性分化分子遗传基础的还很少。先前有研究发现Taslr1基因在大熊猫上存在假基因化现象,这可能与其独特的食性有关,99%都是竹子,食物的改变使其鲜味受体基因功能束缚放松。然而,在食肉目中还有很多其它类群的Taslrl基因未被研究。在这项实验中,我们分析了3个不同食性类群的食肉目动物的Taslr1基因,尤其是小熊猫与大熊猫有十分近似的食性,我们推测小熊猫可能也存在Taslr1基因假基因化现象。本研究以Taslr1基因作为分子遗传标记,利用Premier5、DNAStar、 ClustalX1.83、DNAMAN、MEGA5、PAML4.0等生物学软件,基于分子系统学和生物信息学等分析方法对食肉目动物的分子进化进行了探讨。对序列进行了氨基酸组成、拓扑结构分析、系统发育、选择压力等相关分析,采用邻接法(NJ)、最大似然法(ML)重建食肉目动物间的系统发育关系。得到的主要结果如下:1)首次获得7个食肉目动物Taslrl基因编码序列,分别是猪獾,鼬獾,东北虎,豹猫,小熊猫,黑熊,果子狸。食肉目Taslr1基因cDNA序列全长2526bp,包括6个外显子,其中所测的小熊猫,黑熊,果子狸为完整序列,小熊猫的2525bp,黑熊和果子狸的2526bp,猪獾,鼬獾,东北虎,豹猫为非完整序列约2552bp;2)利用已经测得的基因序列,结合GeneBank中已报道物种的Taslrl基因序列,进行序列比对分析,发现小熊猫物种的Taslrl基因第六外显子有lbp缺失,由于缺失导致移码突变,基因编码的蛋白质失去功能,所以小熊猫Taslrl基因为假基因。实验所涉及到的食肉目动物序列比对发现,只有大熊猫和小熊猫Taslrl基因存在缺失;3)选择性检验表明,Taslrl基因在食肉目动物进化过程中存在强烈的纯净化选择。通过PAML枝模型分析获得,三个不同食性类群之间的选择压力ω(dN/dS)差异不显著,这表明不同食性之间的食肉目动物都经历着相似的净化选择,尤其是Taslrl基因失去功能的大熊猫和小熊猫其ω值没有显著高于杂食动物和食肉动物;4)Taslrl基因的假基因化现象可能是大熊猫和小熊猫在长期适应类似的食物中趋同进化的结果。根据本实验的研究结果,Taslrl基因假基因化现象只在大熊猫和小熊猫两个食肉目动物发现,因此,我们可以推测大熊猫和小熊猫假基因化的原因可能与其独特的食竹性有关,因为这一现象并没有在其他食草类动物中发现,如牛,马等。
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