应用实时荧光定量PCR技术结合DNA直接测序技术检测PINK1基因突变

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背景帕金森病(Parkinson’s Disease, PD)是一种常见的神经退行性疾病,临床表现为静止性震颤、肌强直、运动迟缓、姿势步态异常等,病理以黑质多巴胺能神经元的丧失和路易氏小体(Lewy Body)的形成为特点,约10-15%的PD患者有家族史。常染色体隐性遗传早发性帕金森综合征(autosomal recessive early-onset parkinsonism, AREP)是指除符合帕金森病临床诊断标准以外,遗传方式呈常染色体隐性遗传,发病年龄≤45岁的帕金森综合征;其发病可能与Parkin基因,PINK1基因,DJ-1基因和ATP13A2基因突变有关。多巴反应性肌张力障碍(Dopamine Reacted Dystonia, DRD)是指对小剂量左旋多巴有显著性和持续性反应的肌张力障碍,其主要致病基因为GCH-1基因和TH基因。由于DRD临床表现可能与发病年龄更早的AREP相似:发病年龄早、有肌张力障碍等表现、对多巴制剂反应良好,故有时两者在临床表现上难以区分,因此,基因诊断和分子分型是必须的。国内外研究者对PINK1基因进行突变分析,发现除点突变、小片段缺失或/和插入突变以外,还发现PINK1基因存在外显子重排突变。对于呈杂合状态的外显子缺失突变及呈杂合或纯合状态的重复突变,DNA直接测序常常不能检出,因此为全面检测PINK1基因突变,目前国外普遍采用荧光定量PCR技术结合DNA直接测序技术对PINK1基因进行突变检测。目前国内仅有张玉虎等用DNA直接测序法对PINK1基因进行突变检测的报道,尚未见用实时荧光定量PCR技术检测PINK1基因突变的报道。目的建立应用实时荧光定量PCR检测PINK1基因外显子重排突变的技术平台,结合DNA直接测序方法对本组21个AREP家系和6个DRD家系先证者进行PINK1基因突变分析。方法采用实时荧光定量PER技术检测PINK1基因外显子重排突变,结合DNA直接测序技术检测PINK1基因点突变、小片段插入或/和缺失突变。设置ALB基因为内对照,建立PINK1基因和ALB基因的标准曲线,根据已建立的标准曲线计算PINK1基因和ALB基因相对于标准品的起始拷贝数,PINK1基因相对拷贝数为PINK1基因相对起始拷贝数与ALB基因相对起始拷贝数的比值。结果应用实时荧光定量PCR技术对21个AREP家系和6个DRD家系先证者进行PINK1基因外显子重排突变检测,发现PINK1基因各外显子相对拷贝数均在0.8-1.2之间,在目前公认的正常参考范围之内,提示本组患者不存在PINK1基因各外显子的重排突变;在前期工作的基础上,应用DNA直接测序法对5个AREP家系和3个DRD家系先证者进行PINK1基因点突变、小片段插入或/和缺失突变检测,没有发现PINK1基因的致病突变,发现5个单核苷酸多态(SNPs):c. 189C→T,c. 1018G→A,c. 1023G→A,c. 1562A→C和3’-UTR37a→t,均为已报道SNPs。结论建立了应用实时荧光定量PCR检测PINK1基因外显子重排突变的技术平台,未发现本组患者存在PINK1基因各外显子重排突变;发现了本组患者PINK1基因的5个单核苷酸多态:c. 189C→T,c. 1018G→A,c. 1023G→A,c. 1562A→C和3’-UTR37a→t,均为已报道SNPs。
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