随着网络技术和经济的发展，电子商务已经成为一种非常重要的市场运作模式，深深地改变了人们的思维方式和生活理念，影响了整个世界的生产经营和商品流通。而由农民专业合作社来充当农产品电子商务的市场主体又是在新形势下的选择。首先，它既可以避免单个农户生产的人力、物力和财力的欠缺状况，又能实现农业的产业化经营，促进现代农业技术的应用和推广，早日进入现代化农业时代。其次，在农民的增收和农村经济发展问题上，由农民专业合作社来带领当地农民进行农产品的电子商务可以有效的预防农户生产的盲目性和滞后性，让农民的生产直接与市场相连接，解决我国小农经济与社会化大市场之间的矛盾。最后，利用现有农产品电子商务的经验和教训，借鉴国内外成功的农民专业合作社运营经验，从农民专业合作社发展的阶段出发，构建电子商务的模式又可以直接的指导应用，实现前面两个目标。本文基于对鄂西民族地区利川市农民专业合作社的市场发展的调查，根据其自身自然、社会和经济环境的特殊性导致的农业生产经营模式下农民专业合作社的特殊作用，认识到农民专业合作社在鄂西民族地区农产品电子商务发展中的主体地位和推动作用，再加上对国内外农民专业合作社和农产品电子商务发展和研究的现状的了解，从中提炼出农民专业合作社进行农产品电子商务的要素，最后构建农民专业合作社作为市场主体的农产品电子商务模式。文章在构建农民专业合作社的农产品电子商务模式方面，主要从三个方面进行。第一，从现实市场中总结和提炼出农民专业合作社农产品电子商务的要素：农民专业合作社进行农产品电子商务的参与者、电子交易市场、电子交易过程、信息流、物流和资金流。通过对各个因素进行详细分析，实际上就为农民专业合作社的农产品电子商务营造了一个市场运营的环境。第二，从农民专业合作社进行农产品电子商务的自身条件进行分析。首先，对农民专业合作社的发展进行阶段划分，分为初级、成长、成熟和衰退四个阶段，为后面模式构建提供依据；其次，总结目前农产品电子商务的各种经营应用模式，分为七种经营模式：目录模式、信息中介模式、虚拟社区模式、电子商店模式、电子采购模式、供应链整合模式、第三方电子交易市场模式。以此为农民专业合作社电子商务模式提供可选择的经营方法；最后，从农民专业合作社电子商务技术系统出发，初步确定完整的农民专业合作社进行农产品电子商务的系统，包括电子采购系统、内部管理系统和网络营销系统。第三，理清农民专业合作社电子商务的要素和农民专业合作社的自身情况以后，在电子商务的大环境中，分别从农民专业合作社的四个发展阶段来进行电子商务模式构建，分清个阶段重点需要解决的问题，选择适合的经营模式，建立适当的电子商务系统。