猕猴桃种间高密度遗传图谱的构建及果实性状QTLs定位

来源 :中国科学院研究生院(武汉植物园) | 被引量 : 9次 | 上传用户:likezzz21cn
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猕猴桃作为二十世纪驯化栽培最成功的一种水果,由于其丰富的维生素C含量及营养物质深受消费者的喜爱。由于猕猴桃属植物具有雌雄异株及丰富的倍性变异的特征,使得猕猴桃的传统育种效率较低。对目标性状开发出连锁的标记进行标记辅助选择可以有效的提高育种的效率及准确性。为了定位出果实相关的目标性状,本研究采用父本中华猕猴桃‘桂海4号’和母本山梨猕猴桃‘MT570001’的杂交后代,开展果实大小及糖、酸含量的QTLs定位研究。主要结果如下:(1)利用RAD测序的方法,在174个Fl代植株中构建了中华猕猴桃和山梨猕猴桃两张遗传图谱。母本山梨猕猴桃‘MT570001’图谱包含29个连锁群共2426个标记,图谱长度2651.3 cM,平均图距1.09 cM,每个连锁群的长度为67.3cM至122.5 cM;中华猕猴桃‘桂海4号’图谱共有4214个SNP标记分布在29个连锁群上,总长度为3142.4 cM,平均图距为0.75 cM,连锁群的长度在72.4 cM至151.7 cM之间。(2)通过扫描猕猴桃全基因中的SSR位点发现二碱基重复最多(72.1%),AG/TC (44.2%)是基因组中频率最高的碱基重复。在群体中开发了61个基因组SSR,结合公开发表的49个SSR一起整合到SNP图谱中,成功的定位到中华猕猴桃的28个连锁群上,山梨猕猴桃的17个连锁群上,使得中华猕猴桃图谱长度增加了95 cM,山梨猕猴桃图谱长度增加了67 cM。在群体中筛选出11个性别连锁的SSR标记,并同花表型性状’sex-f’共同定位在25号染色体的亚末端。(3)通过对果实相关的12个性状进行QTLs检测。在山梨猕猴桃图谱中共检测到44个QTLs位点,2013年检测到21个,2015年检测到23个,解释表型变异5.3%-13.9%,在中华猕猴桃图谱中共检测到57个QTLs位点,其中2013年检测到31个位点,2015年定位到26个位点,解释表型变异5.9%-12.2%。本研究结果不仅丰富了猕猴桃属的遗传学研究,也为阐明猕猴桃属雌雄异株及果实品质的遗传机制提供了理论基础,同时为果实品质的遗传改良及早期性别鉴定中提供了分子元件。
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