双峰驼是一个古老的物种，也是荒漠戈壁地区人民重要的生活和生产资料。 由于自然和社会因素的变化和影响，目前家养双峰驼数量急剧下降，尤其是野生双峰驼濒于灭绝的境地。虽然这种情况引起了世界范围的关注，中国、蒙古等一些双峰驼数量较多的国家也采取了一些相应保护措施，但对双峰驼遗传基础和进化规律等方面的研究，才是对其保护、利用和发展的基础与关键。 本实验首次针对双峰驼基因组16个微卫星位点，对中国6个地区和蒙古国7个地区254峰双峰驼基因组DNA样品（含5峰蒙古野生双峰驼）进行了微卫星标记检测和分析。分析结果显示，家养双峰驼杂合度普遍较高，所有群体平均观察杂合度和Nei期望杂合度分别为0.6066和0.6119；16个微卫星位点有较高有效等位基因数和多态信息含量，分别为3.5509、0.5415，可有效用于双峰驼遗传结构和进化分析；F统计量和遗传分化系数分析显示各家养双峰驼群体间遗传分化程度不大；代表整个骆驼群体近交倾向的FIT值（0.1098）偏高，表明骆驼群体有近交现象；遗传距离、聚类分析、基因流、因子相关性分析等结果显示，中国和蒙古国各地区间家养双峰驼间遗传分歧并不显著。但值得注意的是，野双峰驼和家养双峰驼表现出明显的遗传分歧，暗示现存野双峰不是家养双峰驼直接祖先，更不是从家养双峰驼跑到野外的分支。利用内氏标准遗传距离估算家养双峰驼和野双峰驼分歧时间为322,933年左右，基本符合考古学研究结果。 本研究采用的是第二代分子标记技术(微卫星)，在细胞核基因组层面检测和分析了中国和蒙古国不同地区双峰驼的遗传多样性和可能的进化关系，这将对双峰驼的了解、保护和合理利用起到重要参考和指导作用。