我国中小企业是国民经济中最活跃的单元,近几年的发展速度和对国民税收、就业岗位等做出的贡献毋庸置疑。中小板块的成立为我国中小企业融资提供了便利渠道,同时使中小上市公司的经营更加透明化,这就要求中小企业按照更加规范的步调前进。但是我国中小企业受重视的时间较短,理论界对中小企业发展的研究相对较少,特别是中小企业公司治理结构方面。本文以中小上市公司治理结构与绩效关系的研究为核心内容,首先对公司治理结构涉及的内容作了理论综述；然后对现有的、比较有影响力的公司绩效评价方法做出对比分析,并从中选出最适合本文研究的评价指标筛选方法、数据标准化方法以及综合评价方法；最后在理论分析的基础之上,利用比较后选取的评价方法,对公司治理结构和绩效之间的关系作出实证分析。本文采用多指标的综合评价方法,计算出的公司绩效综合评价值更加接近公司的实际情况。在数据选取方面,利用2008年、2009年、2010年的161家上市公司年报,构建了平行数据面板。在指标选选取方面,初步选取16个绩效评价指标和9个公司治理评价指标,再利用减法一致化法和极值法对绩效评价指标做标准化处理,然后采取聚类分析法对指标进行二次筛选,得到7个最具代表性的绩效评价指标；最后采用综合分析法、借助SPSS18.0计算出公司绩效综合评价值。对公司治理结构与公司绩效关系的研究,本文利用9个公司治理评价指标对绩效综合评价值做回归分析,得出各指标与公司绩效的回归系数和显著水平,最终确定各变量与公司绩效的相关关系。文章最后,总结了本次实证研究的结论,并依据结论提出了相应的政策性建议；在结论部分指出了研究内容的不足之处,并对后期研究作出了展望。