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背景与目的:多发性硬化(multiple sclerosis,MS)是一种中枢神经系统白质脱髓鞘性自身免疫疾病,病因尚未完全清楚。普遍认为MS发病与遗传、免疫及环境因素密切相关。Toll样受体(Toll likereceptor,TLR)3、TLR9作为识别病原体的重要受体,在MS免疫学发病机制中扮演了重要角色,然而目前尚无这些分子与MS遗传易感性的研究。本研究通过探讨中国南方汉族人群TLR3、TLR9单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphisms,SNPs)与MS遗传易感的相关性,从基因分子水平探讨MS可能的发病机制,为MS的基因诊断及治疗提供理论依据。方法:采用病例对照研究,以123名临床及实验室确诊的中国南方汉族MS患者和126名与入组病人种族、年龄、性别相匹配的非自身免疫性疾病的患者及健康志愿者为研究对象,外周静脉血提取DNA,利用PCR-RFLP技术检测TLR3、TLR9基因多态性。结果:1、中国南方汉族人群中,TLR3 c.1377位点基因型频率分布分别为:CC 47.4%、CT 44.2%、TT 28.4%,等位基因频率分布分别为C69.5%和T 30.5%;TLR9 -1486基因型频率分别为:TT 39.0%、TC51.0%、CC 10.0%,等位基因频率分别为:T 64.5%和C 35.5%;TLR92848基因型频率分别为:GG 39.0%、GA 51.8%、AA 9.2%,等位基因频率分别为:G 64.9%和A 35.1%。2、TLR3 c.1377基因型、等位基因频率MS组和对照组有显著性差异(P＜0.05),携带T等位基因可降低MS患病危险性(OR=0.532,95%CI=0.322—0.881,P=0.014)。3、TLR9-1486基因型、等位基因频率在MS组与对照组间分布无显著性差异。4、TLR9 2848 A等位基因频率MS组较对照组增多有显著性差异(MS 39.8%vs Control 30.6%;P=0.20)。A~+等位基因携带者比A~-携带者患病危险性明显高(OR=1.837,CI=1.096-3.080;P=0.020)。5、关联分析未发现TLR3 c.1377与TLR9-1486、TLR9 2848有联合作用。6、TLR9-1486、TLR9 2848处于连锁不平衡状态。单倍体型分析单倍体型频率在MS组及对照组间分布无显著性差异。结论:1.TLR3 c.1377基因型频率、等位基因频率及TLR9 2848等位基因频率与中国南方汉族人群MS发病相关,两基因位点可能均是MS的易感基因或与易感基因相连锁。2.TLR9-1486多态性与中国南方汉族人群MS发病无明显相关。