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目的:前列腺癌是全球男性中常见的恶性癌症,与大量遗传突变密切相关,但其生物功能尚未清楚。3非翻译区的单核苷酸多态性影响基因表达水平,其中microRNA调控是一个重要的机制。我们前期基于中国前列腺癌协作组进行全基因组关联分析数据,发现位于胰岛素样生长因子1基因的3非翻译区的rs1815009和rs2684788在前列腺癌及其对照样本中呈显著的基因型分布。本研究通过miRNA预测工具预测结合rs1815009和rs2684788位点及其附近区域的靶miRNA,计算靶miRNAs连接多态性IGF1R3UTR结合过程每个阶段的最小自由能,验证3UTR多态性对靶miRNAs结合的影响,检测靶miRNA对IGF1R基因及肿瘤行为相关基因的调控作用,探讨IGF1R基因3UTR位点多态性及miRNAs结合影响,有助于阐明前列腺癌遗传易感性机制。 方法:1.生物信息学分析:(1)使用TargetScan数据库预测结合rs1815009或rs2684788位点及其附近的miRNA;(2)用miRanda数据库对TargetScan数据库的预测结果进行验证;(3)采用非参数的热力学模型计算IGF1R基因3UTR的位点rs1815009和rs2684788多态性与靶miRNA结合过程中每个阶段的最小自由能;(4)从TCGA数据库下载前列腺癌临床数据、miRNA-seq level3数据;(5)建立纳入标准,从NCBI筛选并下载符合纳入标准的GEO数据;(6)用Students t test和GEO2R分别对纳入的前列腺癌和癌旁组织的TCGA数据和GEO数据进行靶miRNA差异分析;2.miRNA-靶区域结合的实验验证及靶miRNAs的调控作用:(1)双荧光素酶报告基因技术检测位点多态性对靶miRNAs结合的影响,验证结合稳定的位点;(2)脂质体转染技术建立靶miRNA过表达前列腺癌细胞株;(3)荧光定量PCR技术和蛋白免疫印迹技术体外检测靶miRNAs对前列腺癌细胞中IGF1R基因和蛋白表达的调控;(4)荧光定量PCR技术检测靶miRNAs对肿瘤行为相关基因表达的影响。 结果:1.TargetScan7.1预测结果显示种子区在多态性位点rs1815009附近30bp范围内的broadly conservedmiRNAs有miR-133a和miR-133b,在多态性位点rs2684788附近30bp范围内有结合的broadly conserved miRNA有miR-455,这与用miRanda数据库预测结果一致;2.热力学模型预测结果显示,rs1815009等位位点是C等位位点时,所在的IGF1R基因3UTR与miR-133a或miR-133b比等位位点T的rs1815009的3UTR有较稳定的结合;另外,等位位点T的rs2684788所在的3UTR与miR-455有较强的结合能。双荧光素酶报告基因检测实验验证了热力学模型预测的结果;3.TCGA miRNA-seq数据和2套GEO的miRNA数据集(GSE36803和GSE8126)分析显示:除了GSE8126数据集中的miR-133b无显著差异外(P=0.102),前列腺癌组织中的三个靶miRNAs(miR-133a,miR-133b和miR-455)在这三套数据集的表达水平均低于正常组织(P<0.05);4.荧光定量PCR检测过表达靶miRNAs的PC3细胞或LNCaP细胞中IGF1R基因表达水平显示,除了过表达miR-133a的PC3细胞,均为显著低表达(P<0.05);另外,蛋白免疫印迹技术检测结果表明:在过表达miR-133b的LNCaP细胞和过表达miR-455的PC3细胞中IGF1R蛋白出现相似的下调;5.肿瘤行为相关基因(MMP2,CDH1,VEGFA和BCL-2)荧光定量PCR检测结果:MMP2在过表达靶miRNA的LNCaP细胞和过表达miR-455的PC3细胞中表达下调;CDH1基因在过表达miR-133a的LNCaP细胞和过表达miR-455的PC3细胞中表达上调,而在过表达miR-455的LNCaP细胞表达轻微下调;VEGFA基因在过表达miR-133b或miR-455的LNCaP细胞中表达轻微下调,而在过表达miR-133a的LNCaP细胞中是显著下调;BCL-2基因表达水平,在过表达miR-133a的LNCaP细胞中显著上调,而在过表达miR-133b的LNCaP细胞中表达下调。 结论:1.rs1815009和rs2684788等位位点多态性,影响IGF1R基因3UTR与靶miRNAs(miR-133a,miR-133b或miR-455)结合;2.与癌旁组织相比,miR-133a,miR-133b和miR-455在前列腺癌组织中低表达,他们高表达后前列腺癌细胞IGF1R基因的表达下调,影响肿瘤行为相关基因的表达水平,rs1815009C等位位点和rs2684788T等位位点在促进前列腺癌发展上风险性可能更大,遗传突变影响前列腺癌的易感性,有望成为前列腺癌早期诊断的新靶点。