TLR2、SLC11A1及VDR基因交互效应与肺结核治疗失败相关性研究

来源 :新疆医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xulele2
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目的:基于肺结核患者基本信息、临床治疗及管理信息及VDR、TLR2和SLC11A1基因多态性,分析患者治疗失败的相关因素,探索基因与基因、基因与环境交互作用与患者治疗失败的关联性,为制定个体化治疗方案和提高患者治疗成功率提供参考依据。方法:单因素分析患者基本信息、临床治疗管理信息与治疗失败的关联性,多因素logistic回归分析影响患者治疗失败的环境因素。基于遗传学角度分析VD R、TLR2及SLC11A1基因6个SNPs等位基因、单体型及不同遗传学模式(共显性模式、显性模式、隐性模式及超显性模式)与治疗失败的关联性,根据AIC信息准则选择调整环境因素前后最稳定的遗传模式。利用多因子降维法分析基因-基因、基因-环境因素交互作用,根据TBA1及TBA2确定最佳基因交互作用模型,并可视化交互作用的模型图、熵图和树状图,使用决策树模型中E-CHAID算法构建决策树模型验证基因与环境因素之间的交互作用。结果:(1)709例肺结核患者中有673例治疗成功,治疗成功率为94.92%;36例治疗失败,治疗失败率为5.08%。(2)患者基本特征与治疗失败的单因素分析结果显示年龄、患者来源、耐药检测、确诊延迟、治疗管理方式、初次痰涂片及2月末痰涂片与治疗失败存在关联性(均P<0.05)。(3)多因素logistic回归分析结果显示年龄>60岁的患者更容易治疗失败(OR=2.47,95%CI=1.22~5.01);2月末痰涂片阳性患者更容易治疗失败(OR=12.15,95%CI=5.33~27.72);因症来源患者更容易治疗失败(OR=4.24,95%CI=1.81~9.94)。(4)VDR基因(Taq I、Fok I、Bsm I及Apa I)、TLR2基因(T597C)以及SLC11A1基因(D543N)各位点等位基因在治疗成功和治疗失败的分布差异无统计学意义(P>0.05);调整环境因素前后,VDR基因Bsm I位点(rs1544410)在超显性模式下与治疗失败存在主效应(P=0.017,AIC=246.8);其余位点与治疗失败不存在关联。(5)多因子降维分析基因-基因交互作用模型显示VDR、TLR2及SLC11A1基因位点间不存在交互作用;基因-环境因素交互作用模型显示SLC11A1基因D543N位点(rs17235409)、年龄、2月末痰涂片与患者来源交互作用模型最佳(TBA2=0.6774,CVC=10/10,P=0.011);E-CHAID算法构建的决策树模型证实SLC11A1基因D543N位点(rs17235409)、年龄、2月末痰涂片及患者来源之间存在交互作用。结论:年龄>60岁、2月末痰涂片阳性、因症来源是肺结核患者治疗失败的独立危险因素;交互作用模型显示SLC11A1基因D543N位点、年龄、2月末痰涂片及患者来源间存在交互效应,提示患者治疗结局是多基因和多环境共同作用结果,应采取综合措施提供以提高患者治疗成功率。
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