陕西省富平县著有“中国羊乳之都”称号,奶山羊产业已成为该地最大特色主导产业之一,是当地经济发展的重要组成部分。随着其养殖规模的扩大,奶山羊乳房炎疾病的流行,给该产业的发展造成了严重的经济损失。本研究旨在探究该地区患乳房炎奶山羊乳汁中微生物群落的多样性和主要病原菌的流行情况及其部分生物学特性,以期为该地区奶山羊乳房炎疾病的精准防控提供科学依据。本研究从富平县某3家奶山羊场采集临床型乳房炎羊乳样本和健康羊乳样本,通过宏基因组测序,对样本中的细菌群落组成及丰度变化进行分析;对采集的84份临床型乳房炎乳汁样本进行细菌分离与纯化,通过16S r RNA基因序列比对鉴定主要病原菌;对分离纯化的4种主要病原菌,包括凝固酶阴性葡萄球菌、金黄色葡萄球菌、铜绿假单胞菌和化脓隐秘杆菌,进行最小抑菌浓度（MIC）、耐药基因和毒力基因的检测;另外,采用细胞板培养法检测菌株的生物被膜形成能力。试验结果如下:1.针对测序成功的12份样本的宏基因组高通量测序数据,通过聚类分析的方法共得到1界、35门,87纲,211目,377科,708属,1107种。数据分析结果显示,乳房炎乳汁与健康乳汁均有其丰富的菌群多样性,但在菌群结构和丰度方面有较大差异,且乳房炎组内不同样本间也有一定差异;样本总体主要优势菌门为变形菌门、厚壁菌门、放线菌门、拟杆菌门和梭杆菌门,但健康乳汁中未检测到梭杆菌门,乳房炎样本与健康样本各有其主导优势菌门;样本总体主要优势菌属为肠杆菌属、隐秘杆菌属、梭杆菌属、葡萄球菌属和拟杆菌属,但健康羊乳中未检测到隐秘杆菌属和梭杆菌属。2.从84份乳房炎乳汁样本中,经过菌株分离、纯化培养、染色镜检以及16S r RNA基因测序鉴定,共获得细菌74株（88%）,其中包括凝固酶阴性葡萄球菌26株（31%）、金黄色葡萄球菌18株（21%）、铜绿假单胞菌13株（15%）、化脓隐秘杆菌6株（7%）、链球菌3株（4%）、大肠杆菌2株（3%）、伪结核棒状杆菌2株（3%）、溶血性曼氏杆菌2株（3%）、芽孢杆菌1株（1%）和肠球菌1株（1%）。3.通过对4种主要病原菌的药物敏感性检测发现4种病原菌对β-内酰胺类药物的耐药率均为最高,四环素类次之。绝大多数受测菌株均对万古霉素、克林霉素和氯霉素表现敏感。耐药基因检测结果显示β-内酰胺类耐药基因bla Z的整体检出率最高,其次为四环素类耐药基因tet（M）（CNS 80%、金黄色葡萄球菌61%、铜绿假单胞菌84%）和tet（K）（CNS 65%、金黄色葡萄球菌55%、铜绿假单胞菌53%、化脓隐秘杆菌33%）、喹诺酮类glr B（CNS 34%、金黄色葡萄球菌38%）和glr A（铜绿假单胞菌23%）和氨基糖苷类耐药基因aac A-aph D（CNS 42%）。所有受测菌株均未检测到氯霉素类耐药基因。4.针对4种主要病原菌毒力基因检测结果显示,金黄色葡萄球菌毒力基因检出率较高的有溶血素基因hlb（100%）、hla（88%）,肠毒素基因sea（72%）,细胞粘附蛋白基因ica A（66%）和凝集因子基因clf A（61%）,而凝固酶阴性葡萄球菌毒力基因检出率较高的有肠毒素基因sea（80%）、seb（73%）,细胞粘附蛋白基因ica C（65%）和溶血素基因hla（50%）。铜绿假单胞菌毒力基因携带率最高的是T2SS分泌系统基因tox A（84%）,其次为磷脂酶基因plc H（76%）。化脓隐秘杆菌溶血素基因plo和神经氨酸酶基因nan H携带率均为100%。5.生物被膜检测结果显示,金黄色葡萄球菌均可形成生物被膜（18/18）,有9株生物被膜的形成能力为强阳性（+++）;凝固酶阴性葡萄球菌中有20（20/26）株菌可以形成生物被膜,其中4株为强阳性（+++）;铜绿假单胞菌中有10（10/13）株可以形成生物被膜,其中有6株为强阳性（+++）;化脓隐秘杆菌有4株（4/6）可以形成生物被膜,其4株均为中等阳性（++）。综上所述,本研究借助宏基因组测序技术对乳房炎羊乳中菌群结构及丰度变化进行对比分析,证明乳房菌群失调与乳房炎发病之间存在密切联系;另外调查显示该地区奶山羊乳房炎主要病原菌为凝固酶阴性葡萄球菌、金黄色葡萄球菌、铜绿假单胞菌和化脓隐秘杆菌,而链球菌和大肠杆菌较少;针对主要病原菌筛选出敏感药物并获得其部分生物学特性。以上研究结果丰富了该地区奶山羊乳房炎疾病的相关试验数据,希望为该地区乳房炎的防治提供参考。