LMO1基因遗传变异与肾母细胞瘤发病风险的关联研究

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肾母细胞瘤(Wilms Tumor,WT)是全球儿童癌症中最常见的儿科恶性肿瘤之一。目前发现其发病与个体遗传变异有关,本研究采用病例-对照关联研究方法证实LIM domain only 1(LMO1)基因与儿童肿瘤发病密切相关,并发现LMO1基因多态性与WT的易感性相关。目的:探究GWAS发现的LMO1基因4个位点(rs110419 A>G、rs4758051 G>A、rs10840002 A>G和rs204938 A>G)与WT发病风险的相关性及LMO1基因5个潜在功能多态性位点(rs2168101 G>T,rs1042359 A>G,rs2071458 C>A,rs11041838 G>C和rs3750952 G>C)与WT发病易感性的关联。方法:采取基于病例对照研究策略,研究对象包括145名WT患儿和531名健康儿童。通过TaqMan方法对GWAS所发现的LMO1基因4个位点(rs110419 A>G、rs4758051G>A、rs10840002 A>G和rs204938 A>G)以及候选基因策略挑选的5个潜在功能性单核苷酸多态性位点(rs2168101 G>T,rs1042359 A>G,rs2071458 C>A,rs11041838 G>C和rs3750952 G>C)进行基因分型,通过单因素、多因素的Logistic回归分析等统计方法,计算各基因型风险度的比值(OR)和95%置信区间(CI),分层分析各基因型与WT遗传易感性之间的关联。结果:1.在GWAS所发现的LMO1基因4个SNP位点中,仅rs110419 A>G具有统计学差异,可降低WT发病风险(校正OR=0.62,95%CI=0.41-0.94,P=0.024)。2.在LMO1基因5个潜在功能多态性位点中发现LMO1超级增强子rs2168101 G>T多态性对WT具有显著保护作用(GT vs.GG:校正OR=0.58,95%CI=0.39-0.88,P=0.010;GT/TT vs.GG:校正OR=0.67,95%CI=0.46-0.97,P=0.034)。3.发现在rs110419 A>G位点中,AG/GG基因型可降低男性WT患病的危险性,有统计学差异(OR=0.6,95%CI=0.36-0.99,P=0.048),但在年龄和性别因素校正后这种关联消失,无统计学差异。(校正OR=0.61,95%CI=0.36-1.01,P=0.057)。4.携带1~4个危险基因型的儿童患WT风险显著高于无危险基因型的儿童(校正OR=1.84,95%CI=1.25~2.69,P=0.002)。5.携带1~4个危险基因型与WT风险的关联仅限于>18个月大、女性和临床分期III+IV的儿童亚组。年龄(校正OR=2.69,95%CI=1.57-4.61,P=0.0003)、女性(校正OR=2.67,95%CI=1.47-4.85,P=0.001)和临床分期Ⅲ+Ⅳ期(校正OR=2.16,95%CI=1.31-3.55,P=0.002),经校正后具有显著的统计学差异。6.具有3~5个保护基因型的携带者比具有0~2个保护基因型的携带者有更低的患病风险(校正OR=0.62,95%CI=0.42-0.91,P=0.022)。7.发现在rs2168101 G>T位点中,GT/TT基因型的保护作用在男性WT患儿中效果显著,在rs2071458 C>A位点中,GT/TT基因型的保护作用在女性WT患儿中效果显著。结论:1.首次发现LMO1基因多态性与中国南方人群中肾母细胞瘤易感性有关。2.LMO1基因rs110419 A>G多态性可降低WT发病风险。3.LMO1基因rs2168101 G>T多态性可能有助于预防WT。4.携带1~4个危险基因型且超过18个月大的女童患WT风险明显增加。5.具有3~5个保护性基因型共同降低女性患WT风险。
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