北疆葫芦科作物Potyvirus属病毒种类的分子鉴定与遗传分化研究

来源 :石河子大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:FJHGL
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瓜类作物是新疆重要的经济作物之一。近年来,病毒病的发生和危害直接威胁着新疆瓜类作物的生产和发展。随着品种的更新引用,发生在瓜类作物上的病毒病种类越来越多,病毒的致病性多种多样,引起的瓜类症状类型更加复杂,给瓜类作物的产量和质量造成了严重的损失。对此,本论文对侵染北疆瓜类作物上的马铃薯Y病毒属(Potyvirus)病毒种类进行了初步的鉴定和研究。近年来,国内已报道的发生在瓜类作物上的Potyvirus病毒属中的西瓜花叶病毒2号(WMV-2),小西葫芦黄化花叶病毒(ZYMV)及番木瓜环斑病毒西瓜株系(PRSV-W)危害最为严重(原先的WMV-1经过长久研究证明其实是番木瓜环斑病毒的一个株系PRSV-W)。从昌吉、石河子等地采集到多种带病的瓜类作物样品,根据已报道的WMV-2、ZYMV、PRSV基因序列设计引物,采用RT-PCR的方法,扩增外壳蛋白(CP)基因的cDNA片段,将其克隆到Vector pMD18-T载体上并进行测序和序列分析。结果表明:从石河子地区采集到的丝瓜、甜瓜及黄瓜上分离获得的五个ZYMV片段的cDNA全长1185bp,其中包括CP基因长837个核苷酸编码的279个氨基酸,及NIb区域135个核苷酸,编码的45个氨基酸,与国内外已报道的7个ZYMV序列比对,其核苷酸其同源性高达94.44%,氨基酸序列同源性高达97.48%,由此从分子水平证明了该病毒为ZYMV;从昌吉地区的南瓜上获得的WMV-2片段cDNA全长917bp,该分离物CP基因全长为850个核苷酸,编码了197个氨基酸,与国内外已报道的12个WMV-2 CP基因相比,其核苷酸序列同源性为93.6%~97.5%,由此推导的氨基酸序列同源性为94.9%~98.9%,分离物在N端可变区明显不同于国内外报道的核苷酸序列,和日本、郑州分离物较其它国家地区的分离物多出6个核苷酸,但其核苷酸及其推导的氨基酸序列差异较大,再则,该分离物外壳蛋白有2个氨基酸残基明显不同于其它分离物,其中蚜传株系的特征结构域DAG突变为DAE。
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