猪琥珀酸脱氢酶D亚基基因的单核苷酸多态性检测、表达谱研究、辐射杂种板定位及性状关联分析

来源 :华中农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wdongjiang
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养猪业是畜牧业的一个重要产业,通过分子遗传学途径对猪的遗传机理进行研究可加深对猪基因的结构、功能及与性状关系等的了解,推动动物育种理论的发展以及为猪育种工作提供更多的可作为标记辅助选择(marker assisted selection,MAS)的候选基因。 本研究主要对猪琥珀酸脱氢酶D亚基(succinate dehydrogenase complex,subunit D,SDHD)基因第四外显子中的单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphisms,SNPs)进行检测,并在通城试验猪群中进行突变位点与性状的关联分析,利用辐射杂种板对该基因进行染色体定位以及对该基因的表达谱研究。取得以下研究结果: 1.以猪胚胎期骨骼肌cDNA文库测序获得的猪SDHD基因cDNA序列设计特异引物,分离该基因第四外显子中部分片段: 2.对所分离的基因片段进行SSCP检测,挑选不同的SSCP纯合型的具有代表性的个体进行PCR产物测序,发现在SDHD基因Exon4中的CDS区存在两个SNP位点,两个SNP位点中有一个引起了氨基酸的改变,但无内切酶位点,另一个SNP位点的突变为同义突变,存在一个MboI酶切位点; 3.在无亲缘相关群体中分别进行SSCP检测和使用MboI进行RFLP检测,并对各自的基因型进行了基因频率计算和基因在群体中分布的显著性检验,结果表明:基因频率和基因型频率在不同猪品种中的分布存在不同的差异显著性; 4.在通城试验猪群中进行RFLP检测,将RFLP基因型与该试验猪群中的部分性状进行了关联分析,发现猪SDHD基因MboI酶切位点的SNP与眼肌面积显著相关(P=0.0067),与肌肉大理石纹的相关接近显著(P=0.0614); 5.以通城猪和鄂西黑猪的肾、心、脾、肺、肝五个组织进行该基因的表达谱研究,结果表明该基因在所检测的各个组织中均有表达。 6.利用辐射杂种板将猪SDHD基因定位在猪染色体9p21。
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