造血因子家族蛋白立体结构与进化关系的初步比较和分类

来源 :中国人民解放军军事医学科学院 解放军军事医学科学院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:geweiqi0219
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该文主要针对细胞因子中蛋白晶体结构已知的典型造血因子进行立体结构数据的比较与分类研究.作者使用自行编制的二级结构数据提取程序,将PDB数据文件中二级结构信息及其相关的原子坐标数据联系起来,再把具有方向性的α螺旋和β片导等二级结构所在蛋白骨架的α碳原子坐标值带入直角坐标系中,并计算出所应的空间几何向量;然后,通过对这些空间几何向量的取模、量角等进行计算,其结果作为表现蛋白结构特征的一种简单的量化,再联合利用其它现成软件的视化观察等表现二级结构在空间的位置与相关关系的方法,得出一种较为普遍的共同折叠构象--"Mobius 条带"模式的折叠,并初步探讨了其意义.为取得更加客观的针对造血因子中特征性的"四螺旋束"的结构分类,还分别利用螺旋标量、螺旋夹角以及两者加权联立对造血因子家族成员进行了聚类分析.
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