基因转录调节动力学中的随机性质:涨落诱导基因开关

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在Smolen等人于1998年提出的确定论模型的基础上,根据实验的结果,该文在蛋白质的降解率和蛋白质的基本合成率上分别考虑它们的涨落.这样原来研究的确定论非线性模型就转变成了含噪声的朗之万方程(LE).由于实验是无法测出基因的状态是处于开还是关.因此要研究基因的状态往往都是考虑这段基因转录出来的蛋白质分子的浓度:蛋白质水平高则基因处于开的状态;蛋白质水平低,则基因处于关的状态.我们首先考虑这两个噪声的来源没有叠加即是独立来研究噪声对基因状态的影响.可以看到源于蛋白质基本合成率的噪声强度不能引起基因状态的转变(即基因的开关)而源于降解率噪声强度则能够实现这种开关.当进一步研究在降解率波动作用下基因从一个态跃迁到另一个态的平均首通时间(MFPT)时可以看到此时随着这个波动强度的增加,MFPT是单调递减的.其次,由于噪声的来源往往是相互关联的,这就决定了系统的噪声是相互关联的,所以接下来,该文对原有LE引入噪声之间的关联.在关联的作用下,不但降解率上的波动可以控制基因状态的开关,合成率上的波动也可以作为一个控制参数.噪声诱导的基因开关的转换是噪声对原有调节系统作用的一个较直观和重要的作用.这些基因开关的控制参数,即波动的强度或是他们之间的关联,可以作为基因药理学研究的靶参量.通过对这些参数的控制来达到特定的治疗目的.
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