本文应用随机扩增多态DNA（RAPD）技术，结合一定的形态学研究手段，对五种长臂虾的遗传多样性和亲缘关系进行了分析。 从40个随机引物中筛选出33个对两种越南古洁虾进行RAPD扩增，共扩增出304个DNA片段。在越南古洁虾指名亚种和越南古洁虾广东亚种中分别扩增出279和296个DNA片段，其中多态性片段数分别为184和191，多态性片段的比例（P）分别为65.9％和64.5％。越南古洁虾指名亚种和越南古洁虾广东亚种的遗传多态度（H_o）分别为0.163和0.129，两种群的遗传变异H_pop/H_sp均值为0.942，而种群间的遗传变异(H_sp-H_pop)/H_sp均值为0.058。未获得可区分两种越南古洁虾的RAPD标记。通过DPS（3.11专业版）种群遗传分析软件包、采用UPGMA方法分析，其聚类结果为广东亚种12个个体先相聚，然后与指名亚种的2个个体相聚，最后才与指名亚种的另4个个体相聚，这与形态学分析的结果不一致。两种群的遗传相似度（S）高达0.943，遗传距离（D）仅为0.057。 从40个随机引物中筛选出31个对三种沼虾进行RAPD扩增，共扩增出450个DNA片段。在胖掌沼虾、海南沼虾和台湾沼虾中分别扩增出353、316和290个DNA片段，其中多态性片段数分别为228、147和132，多态性片段的比例（P）分别为64.6％、46.5％和45.5％。胖掌沼虾、海南沼虾和台湾沼虾的遗传多态度（H_o）分别为0.211、0.135和0.142，种群内的遗传变异H_pop/H_sp均值为0.682，而种群间的遗传变异(H_sp-H_pop)/H_sp均值为0.318。获得33个RAPD标记，其片段长度在259-3333bp之间．通过DPS（3.11专业版）种群遗传分析软件包、采用UPGMA方法分析，其聚类结果为各种的个体先分别相聚，然后海南沼虾与台湾沼虾相聚，最后与胖掌沼虾相聚，这与形态学分析的结果一致。海南沼虾与台湾沼虾、海南沼虾与胖掌沼虾、台湾沼虾与胖掌沼虾的遗传相似度（S）分别为0.845、0.694和0.706，遗传距离（D）分别为0.155、0.306和0.294。