当前，我国的高等教育正处在迅速发展的时期。高等学校在不断扩大办学规模、提高办学层次的过程中，其财务管理体系已不能适应高等教育发展的要求，亟需建立一整套充满活力的运行机制。本文通过实证研究，采用定量分析的方法，探讨高等学校财务管理体系的优化问题。 本文首先在分析我国高校财务管理现状的前提下，针对高校财务管理中存在的问题，根据高校财务管理的目标，采用业务流程再造的方法，重构了财务管理组织结构，优化了高校财务管理体系，并且采用全面预算管理改进了高校财务管理方法；其次是对高校财务评价指标体系进行了重建，构设了反映学校财务收支、综合实力和运行绩效的基本指标，在此基础上，构建了反映学校综合经济效益的评价模型，使不同地区、不同时期的各类高校的办学效益有了可比性；最后采用实证分析的方法，以南昌某高校的财务管理体系为例，对其组织结构和财务管理方法进行了分析和优化，建立了财务分析和评价的基本指标，并运用这些指标对财务状况和经济效益进行了评价，建立了高校综合经济效益评价的社会标准，并运用该标准对该高校的办学效益进行了综合评价。 本文通过理论和实践相结合，建立了符合我国国情的高校财务管理体系和评价指标体系，得出的方法有一定的实践性和操作性，对国内高校改进和加强财务管理体系建设具有一定的参考和借鉴作用。