血浆lncRNAs作为胃癌诊断潜在生物标志的研究

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背景:我国一直是胃癌(gastriccancer,GC)高发国家,每年胃癌发病数和死亡数均占世界总数的50%左右,疾病负担严重,是肿瘤防治的重点。胃癌患者多没有特异性症状,因而诊断时大多数患者已处于进展期,进展期胃癌预后较差,术后五年生存率低于30%,而早期胃癌预后良好,术后五年生存率可以达到90%以上,因此寻找能够鉴别早期胃癌、且具有高敏感性和特异性的生物标志至关重要。长链非编码RNAs(long non-coding RNAs,lncRNAs)是指长度超过200个核苷酸且没有蛋白编码能力的RNA转录本。目前大量研究已经表明lncRNAs在肿瘤发生发展过程中发挥着重要作用。近年来,lncRNAs被发现可以释放到循环中且稳定存在,且循环lncRNAs的表达水平在肿瘤患者和健康对照体内存在显著差异,有可能作为肿瘤潜在生物标志而改善肿瘤的早期诊断。目前循环lncRNAs的研究尚处于起步阶段,循环lncRNA的来源及其功能还未系统阐明。方法:本研究采用Arraystar Human lncRNA/mRNA v3.0芯片技术,检测并分析5例胃癌病例及5例性别、年龄相匹配健康对照的全基因组血浆lncRNAs;以胃癌患者血浆中高表达最显著的前10条lncRNAs作为本研究的候选lncRNAs,运用实时定量 PCR(quantitative real-time polymerase chain reaction,qRT-PCR)技术进行两阶段血浆大样本(一阶段包括50例胃癌病例血浆和50例健康对照血浆,二阶段包括173例胃癌病例血浆和173例对照血浆)验证,通过受试者工作特征曲线(receive operating charactreristic curve,ROC)分析及计算曲线下面积(area under the curve,AUC),评价单个或一组lncRNAs对胃癌诊断的应用价值。同时,本研究利用实时定量PCR检测了血浆lncRNAs在经历反复冻融或室温放置一段时间后的稳定性,并通过不同的胃癌细胞系及胃癌病例术前术后的血浆样本探讨血浆lncRNAs可能的来源;此外,本研究利用细胞生物学的方法,初步分析了血浆lncRNAs对胃癌细胞恶性表型的影响。结果:芯片分析筛选出差异表达的lncRNAs共3,878条,其中在胃癌患者血浆中表达上调的有603条,表达下调的有3,275条。两阶段血浆样本验证发现RP11-47304.5、GUSBP11 和 CTD-2303H24.2 这 3 条 lncRNAs 在胃癌病例血浆中显著高表达;lncRNAs稳定性检测发现,在血浆样本经历反复冻融或室温放置一段时间后,这3条lncRNAs的表达量均无显著差异;ROC曲线分析发现,这3条lncRNAs单个或者组合对胃癌诊断均有一定的价值,其中CTD-2303H24.2单独诊断的价值最大,而这3条lncRNAs的联合诊断价值要高于单个lncRNA的诊断价值,AUC为0.818,灵敏度为77.5%,特异度为73.9%;lncRNAs来源分析发现,不同的胃癌细胞培养液中均可检测到这3条lncRNAs,且胃癌患者术后血浆中lncRNAs的表达水平显著低于手术前的表达量;细胞功能实验发现,过表达RP11-47304.5可促进胃癌细胞的增殖和侵袭能力,干扰RP11-47304.5表达可抑制胃癌细胞的增殖和侵袭能力。结论:本研究发现了三条新的胃癌相关的血浆lncRNAs RP11-47304.5、GUSBP11和CTD-2303H24.2,这3条lncRNAs在血浆中稳定存在且在胃癌患者血浆中显著高表达,可以较好地区分健康对照和胃癌患者,可作为潜在的胃癌早期诊断的循环生物标志。进一步的功能学研究发现,RP11-47304.5与胃癌细胞的增殖和侵袭作用相关。
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