目的 本研究旨在建立脑蛋白质组研究的技术平台,获得可靠的小鼠脑蛋白质组数据库,比较和评估小鼠不同发育阶段的脑蛋白质,为下一步进行神经系统疾病的蛋白质组学研究奠定基础。方法 样品来源于国际脑蛋白质组委员会所提供的胚胎16天、出生后7天及生后60天等3个发育时期的C57/B16雌性小鼠脑组织。常规方法提取组织总蛋白,采用固相pH梯度的二维电泳分离和串联质谱分析等进行鉴定,使用Mascot软件搜索UniProt数据库,鉴定蛋白种类。结果 获得3个不同发育时期小鼠脑组织蛋白质表达谱,完成国际脑蛋白质组计划的预实验所要求的质量控制,鉴定出3个发育阶段均有较稳定表达的4个蛋白点,包括α烯醇酶、磷蛋白质P19及2个肌动蛋白。经进一步评估后鉴定出随年龄增大而丰度减低的C14orf166同源蛋白、28×10~3热/酸稳定的磷蛋白、40S核糖体蛋白及演变为紧邻双点的3-巯基丙酮酸硫基转移酶。其中α烯醇酶及C14orf166同源蛋白曾有文献报道与神经发育及组织发生有密切相关。并通过蛋白免疫印迹技术对不同发育阶段的α烯醇酶进行了验证。结论 蛋白质组学的方法为脑发育研究提供了有参考价值的数据,其差异蛋白的发现可促进对神经发育机制的了解,并将为后续启动神经系统疾病蛋白质组学研究提供参考。