犏牛是牦牛与黄牛杂交的种间F1代杂种,其具有明显的杂交优势,在产奶量、肉产量、体型和役用能力都很突出。而蛋白质是生命活动的执行者,其参与生命的整个过程,具有多样性和复杂性等特点。了解其肌肉生长发育及脂肪沉积相互间的差异蛋白调控关系,对牦牛和犏牛在繁殖育种工作中具有重要意义。因此,本研究利用串联质谱标签技术并结合生物信息学方法筛选牦牛和犏牛背最长肌及皮下脂肪间的差异表达蛋白,并对差异蛋白进行生物信息学分析。实验以各3头成年的母牦牛及犏牛,采集背最长肌和皮下脂肪组织,提取各组织总蛋白后利用TMT技术进行差异表达蛋白鉴定。经TMT试剂标记后进行质谱鉴定和蛋白数据库搜索及生物信息学分析。主要研究内容和结果如下:1.当0.06≥FC≥1.4,同时p-value≤0.05时,皮下脂肪中差异显著蛋白37个,背最长肌中差异显著蛋白个数113个。2.通过GO显著性分析发现,在皮下脂肪中差异蛋白富集到64个GO term中,主要集中在细胞外基质结构成分、氧化还原酶活性、纤维蛋白复合物和氧化还原过程中;在背最长肌中,差异蛋白富集在128个GO term中,主要集中在催化活性、线粒体内膜、代谢过程和ATP代谢工程中。3.KEGG信号通路分析结果表明,在皮下脂肪中,差异蛋白总共匹配到66条KEGG信号通路,主要有蛋白消化吸收、类固醇激素的合成和受体相互作用等通路。在背最长肌中,差异蛋白总共匹配到77条KEGG信号通路,主要有丁酸酯代谢、碳代谢和柠檬酸循环等。4.差异蛋白互作分析结果表明,在皮下脂肪中,肌腱蛋白X前体、含黄素胺氧化酶B、酰基辅酶A合成酶ACSM1和金属蛋白酶抑制剂2前体等蛋白在网络连接度较高,可能在脂肪沉积机制中发挥重要作用。在背最长肌组织中,谷胱甘肽转硫酶M1、NADH-异柠檬酸脱氢酶和前列腺素还原酶1等蛋白在网络连接度较高,这些蛋白可能在肌肉生长发育过程中发挥重要作用。本次试验研究筛选出多种与肌肉生长发育和脂肪沉积相关的差异表达蛋白,更加全面的了解了牦牛和犏牛背最长肌及皮下脂肪组织中蛋白表达情况,为深入研究牦牛和犏牛在背最长肌及皮下脂肪组织发生机制奠定了良好基础。