基于UPLC-Q/TOF和1HNMR的代谢组学技术在乳腺癌步研究中的应用

来源 :广东药学院 | 被引量 : 3次 | 上传用户:LIUCHANGQI2003
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
实验目的:初步建立基于1HNMR技术和的UPLC-Q/TOF(液质联用)技术代谢组学方法,并将该方法应用于乳腺癌患者血清中内源性代谢物的变化,寻找乳腺癌相关诊断标志物。在此基础上初步比较了化疗方案AC(阿霉素+环磷酰胺)干预前后乳腺癌患者血清中代谢物的变化,观察化疗方案干预后患者体内血清中内源性代谢物的变化趋势。研究方法:1.研究对象的纳入:选取体检结果正常的11例健康人作为正常对照组;选取符合纳入标准的16例初诊乳腺癌患者作为实验组。2.标本采集:采集11例正常女性静脉血,分离并收集血清;分别采集实验组16例乳腺癌患者在化疗前及化疗一个疗程后的静脉血,分离并收集3.建立基于1HNMR技术的血清代谢组学分析方法,包括实验方法和模式识别方法的选择。并将建立的方法正常女性和实验组化疗前血清的代谢组学分析,找出血清中代谢物的差异;同时将方法应用于AC方案干预前后乳腺癌患者血清中的代谢物变化。通过文献检索和数据查询找出血清中差异。4.建立基于液质联用技术(UPLC-Q/TOF)技术的血清代谢组学分析平台,并将建立的方法正常女性和实验组化疗前血清的代谢组学分析,找出差异;同时将方法应用于AC方案干预前后乳腺癌患者血清中的代谢物变化。和1HNMR技术研究结果进行比较。5.数据分析:通过多种分析统计分析方法对产生的海量数据进行分析,分析过程包括:归一化、修正80%规则、数据集分割和数据缩放等方法对数据集进行预处理;通过数据分析:采用主成分分析(principal componentanalysis,PCA)、正交偏最小二乘判别分析(OrthogonalPartial Least-Squares Discriminant Analysis,OPLS-DA)进行模式识别分析;根据模型的变量重要性因子(VIP值)、非参数检验结果和P值筛选潜在标记物。实验结果:1.建立了1H-NMR的血清代谢组学方法,健康女性和乳腺癌患者化疗前、化疗方案干预前后两个组经代谢组学方法得到很好的区分,并找到了相对应的16个乳腺癌肿瘤标志物。乳酸(lactate,1.33、4.12),缬氨酸(valine,0.99/1.04),N-乙酰糖蛋白(N-acetylgly-coproteins,2.04),谷氨酰胺(glutamine,2.41),磷酸胆碱/胆碱(phosphocholine/cholie,3.22),葡萄糖(a-glucose和B-glucose,3.40-3.90,4.66,5.22),酪氨酸(tyrosine,6.87,7.17),组氨酸(histidine), LDL/VLDL,不饱和脂肪酸等峰有增大或减小的表现。2.建立了UPLC-Q/TOF-MS的血清代谢组学研究方法,发现胆碱类和苯丙氨酸、异亮氨酸在正常人和乳腺癌患者化疗前有不同,其中化疗后的乳腺癌患者血清中的胆碱类有向正常变化单位趋势。1HNMR技术所得到的标记物和UPLC-Q/TOF得到的标记物大部分不同,但是分组聚类结果类似。结论:~1HNMR技术和UPLC-Q/TOF技术作为常用的代谢组学分析工具,在标记物发现中有一定的互补性。通过对正常人和乳腺癌患者化疗前后的代谢组学研究,得到了三者的代谢谱,发现本文所建立的NMR技术和UPLC-Q/TOF技术为基础的代谢组学方法应用于乳腺癌患者血清中具有良好的聚类效果。
其他文献
理性是西方哲学的一个核心理念,既与神性相对立,又超出人的自然本能。人的理性本质在于以理性为道德立法。道德与理性的悖论则在于道德的“理性化”过程,即误把工具理性运用在道
目的本研究以东部、中部和西部三个地区12个县267所乡镇卫生院为研究对象,利用卫生院2015年度收治的疾病信息理清乡镇卫生院现阶段能够收治的疾病种类,利用机构的基线数据了
报道跳小蜂科跳小峰属一新种,三色颚跳小蜂,Encyrtus manditricolor sp.nov。标本采自云南2省,从番石榴Psidium yuayava年一种网蜡蚧Eucalymnatus sp.育得。
本文认为中国前小说叙事经历了一个寄生子史而旁出的嬗变过程。在此过程中,小说的基本因素得以孕育、发展,小说的叙事技巧得到运用并日趋丰富。子部和史部这两大部类的前小说对
本文通过分析各国央行资产负债表的资产方,得到结论,各国央行的总资产规模持续扩大;强势货币国家主要以本国资产为基础发行货币;非强势货币国家以强势货币国家的货币或债券为
以无定型硅铝为载体,在实验室开展了制备条件对食品级白油加氢催化剂活性影响的研究。研究结果表明,双贵金属浸渍时p H对催化剂活性影响明显,p H为9-9.5时可以得到活性良好的
随着大批人口涌入城市,居住区、商业区、公共服务区等需求量剧增,城市建筑占地面积快速增长,楼房越盖越高,楼间距越来越小,到处是水泥森林景象。绿地面积所剩无几,城市土地资
在大数据时代,第三方机构利用新技术,通过对客户数据的发掘分析,实现了对传统零售银行业务领域的全面渗透,且发展迅猛。论文通过梳理国内外金融行业大数据技术的应用现状,系
相比于电源系统、液压系统等飞机其它子系统,A320系列飞机引气系统设计的可靠性水平较低,且部件多为敏感器件,该系统故障率高居不下,对飞机的安全性有不利影响。基于案例推理