科技资源优化配置是科技管理和科技政策优先关注的核心问题之一，是资源配置的重要方面，是科技创新体系建设的基础。科技资源具有稀缺性与长效性特征，决定了世界各国将科技资源优化配置视为重大战略问题。 本文以辽宁高校科技创新体系建设项目为背景，对辽宁高校科技资源配置效率进行了评价，并对影响科技资源配置效率的相关因素进行了定量分析。在对配置效率分析过程中，本文针对以往评估方法主观性较强的缺陷，从投入—产出角度出发，研究了基于数据包络分析的系统模型特征，解决了系统投入—产出关联关系难以确定的难题，为决策者提供更科学的支持和帮助。在评价配置效率的基础上，运用回归分析、相关分析等数理方法分析了影响配置效率的规模、结构要素，运用带偏好的数据包络分析模型对影响配置效率的各投入指标进行了比较分析，从而获得了一系列配置效率与影响要素的相关关系。 为了将上述决策模型进一步应用于辽宁省高校科技资源配置系统中，我们开发了辽宁省高校科技资源配置决策支持系统。论文对系统分析、系统设计进行了详细阐述，最后是程序设计与系统实现。整个系统设计科学、应用全面、操作简单，为提高决策的科学性，优化高校科技资源配置提供了一套切实可行的方法和技术。