木薯制片技术的优化及遗传标记位点特异引物的筛选

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木薯是众多重要的能源作物之一,国内外许多实验室致力于木薯功能基因的研究。本实验室近几年主要针对Xin Chen等(2010)、Sraphet等(2011)发表的两份木薯遗传图谱,利用课题组建立的荧光原位PCR技术体系着重于其遗传图谱的物理定位工作,进行了部分连锁群与染色体的整合。而高效地制备出优质染色体标本及筛选高特异性的各连锁群两端标记引物,是有效进行木薯分子遗传图谱的连锁群与相应染色体整合的基础。本研究以木薯华南6号为实验材料,在Sraphet等(2011)发表的木薯遗传图谱的7号、9号、14号及20号连锁群两端各选取1个标记,共选取8个标记进行了其相应特异性引物的筛选;同时针对课题组建立的木薯染色体标本制备技术,在取材时间、气温、湿度及酶解时长等方面进行了进一步优化。结果表明:引物NS158-L9、NS198-L9、SSRY2-L20、SSRY 44-L14、SSRY 160-L7能特异地扩增出2个片段,而NS978-L7、SSRY194-L20、SSRY248-L14均能特异性扩增出1个片段,大部分引物扩增产物片段长度在100-300bp之间,可以作为相应连锁群两端标记的特异引物用于后续的荧光原位PCR定位研究;实验研究发现,取材时间为晴天早上9:00~10:00间,气温30℃,空气湿度为80%左右时,所取的木薯根尖材料制备出的染色体标本中期细胞较多,且染色体经过处理后形态较好,利于观察和核型分析。夏季取得根尖材料用5%纤维素酶和4%果胶酶混合酶液37℃酶解4h 20mi n左右较适宜,而在冬季则需要酶解5h左右才能使所制得标本的细胞背景少。本研究为后续有效开展木薯分子遗传图谱与染色体核型的整合奠定了一定的基础。
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