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近20年的科学研究发现，在自然界及生命系统等领域中存在一个复杂系统，这一系统的研究方法是利用专家和群体的经验，定性判断与定量计算相结合，微观分析与宏观分析相结合，还原论与整体论相结合，科学推理与哲学思辨相结合。研究着重揭示客观事物构成的原因及其深化历程，并尽可能准确地预测其发展。中医的证候和复方是中医理论基础和临床体系的重要支撑，利用证候及复方理论治疗疾病有效已为几千年临床实践所证实。但当一个个单一的证候组合成复杂证候时，当一味味成分清楚的药物组成复方时，研究则产生了极大的困难。在相关领域的成果可以帮助我们使用复杂方法及数学工具，当复杂新理念运用使我们能从过去无人知晓的角度和深度来认识及揭示复杂而有序的中医方证时，有可能在学科研究中导致新的进展。