整合分析斑马鱼hif-1α抑制后的miRNA和mRNA表达谱以及let-7b/7f在细胞增殖和周期中的作用

来源 :中国海洋湖沼学会、中国动物学会鱼类学分会第九届会员代表大会暨2014年学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xiaomantou_2001_78
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  低氧诱导因子1 alpha (Hif-1α)在血管生成,红细胞生成以及在正常细胞和肿瘤细胞内的低氧压力应答中是一个核心的调控因子。本研究中我们首先构建了6个斑马鱼hif-1a的干扰载体,显微注射到斑马鱼胚胎中,通过qRT-PCR和Western blot筛选出高效特异的hif-1α干扰载体。然后基于RNA-seq获得了hif-1a抑制后的斑马鱼胚胎miRNA和mRNA表达谱,筛选了11个差异表达的miRNA,通过整合表达并结合生物信息学分析,筛选其靶基因。最终在7个差异miRNA上鉴定出76个靶基因,对这些靶基因的GO和KEGG通路分析表明这些基因主要参与胚胎发育。而启动子分析显示这些差异表达miRNAs可能是受Hif-1α调控。另外通过比较分析发现let-7家族在低氧条件下表达差异极其显著,可能在氧应答过程中扮演重要作用。进一步实验表明,抑制hif-1a会导致let-7b/7f的下调表达,而ZF4细胞中过表达let-7b/7f会改变细胞周期过程,抑制细胞周期中G1到S期的过度,引起细胞增殖的阻滞。同时我们通过体内外实验鉴定了let-7b/7f的靶基因foxh1,它也直接和间接的参与了细胞增殖过程。综上所述,hif-1a通过let-7b/7f和foxh1介导的通路调控细胞增殖。
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