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目的 探讨深圳市结核分枝杆菌对利福平、异烟肼耐药变化趋势,为结核病防控策略调整提供依据。方法 对2002—2016年深圳市登记的所有涂阳肺结核病患者进行痰检,对罗氏培养阳性菌株进行菌型鉴定和耐药检测,采用Joinpoint regression program软件计算年度变化百分比并进行趋势检验。结果 共检测17056株结核分枝杆菌菌株,其中单耐异烟肼1619株,单耐利福平921株,同时耐异烟肼、利福平709株。2002-2011年深圳市结核分枝杆菌异烟肼耐药率以每年3.84%的平均速率下降(Z=-2.58,P=0.04);2011-2014年以每年5.96%的平均速率上升(Z=0.58,P=0.58);2014-2016年以每年23.13%的平均速率再次下降(Z=-1.36,P=0.21);2002-2004年深圳市结核分枝杆菌利福平耐药率以每年25.66%的平均速率下降(Z=-1.71,P=0.13);2004-2014年以每年0.28%的平均速率波动(Z=1.72,P=0.13);2014-2016年以每年32.34%的平均速率下降,(Z=-2.26,P=0.06)。2002-2004年深圳市结核分枝杆菌同时对异烟肼、利福平耐药率以每年44.04%的平均速率下降(Z=-0.76,P=0.49);2004-2008年以每年平均1.35%的平均速率波动(Z=0.74,P=0.50);2008-2011年以每年7.68%的平均速率下降(Z=-0.42,P=0.70);2011-2016年再次以5.92%的平均速率上升(Z=0.67,P=0.54)。结论 深圳市结核分枝杆菌对异烟肼、利福平耐药率均呈阶段性变化,其中对异烟肼、利福平单耐药率在波动中呈下降趋势,而耐多药结核分枝杆菌检出率近年来在波动中呈上升趋势,且以传播导致的耐药为主,应该调整防控策略,把重点转移至加强结核病患者的主动发现,做好传染源的隔离,特别是痰检阳性耐多药结核病患者。