拟南芥与芸薹属比较基因组学分析鉴定甘蓝型油菜千粒重QTL的候选基因

来源 :中国作物学会油料作物专业委员会第七次会员代表大会暨学术年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:lv_yj
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  虽然在甘蓝型油菜中已经鉴定了大量控制千粒重的QTL,但关于这些QTL候选基因的信息仍然非常少.在本研究中,我们利用SSR标记和甘蓝型油菜DH群体,构建了一张全长为2,126.4cM、标记平均间距为5.36cM的全基因组遗传连锁图.我们开发了一个确立甘蓝型油菜SSR位点与其祖先种白菜和甘蓝基因组同线性关系的程序.借助白菜和甘蓝基因组的序列信息,将甘蓝型油菜SSR位点的421个同源共线性位点对应到拟南芥基因组中的398个同源位点.利用甘蓝型油菜和白菜、甘蓝以及拟南芥的比较作图分析,我们将227个控制粒重/种子大小的白菜/甘蓝同源基因定位到甘蓝型油菜遗传图谱,确立了异源四倍体甘蓝型油菜中这个重要农艺性状的遗传基础.我们预测了8个粒重QTL位点的12个候选基因,并且利用甘蓝型油菜粒重基因分布图和分子克隆开发了BnAP2的基因特异标记,验证了该方法的正确性和有效性.本研究结果表明,利用基于SSR标记的遗传图谱开展甘蓝型油菜与其祖先种白菜、甘蓝以及拟南芥的比较基因组学分析来鉴定QTL位点的候选基因的方法是可行的.
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