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荧光信号光谱分析中，噪声的存在常会影响分析的准确度和检出限。传统的滤波方法在光谱信号去噪方面有种种不足。小波分析由于具有良好的时频域分辩特性使得它成为一种很好的去噪方法。在一维信号的小波去噪处理中，如何选择合适的小波基函数和去噪阈值直接关系到信号去噪处理的质量。通过对微芯片毛细管电泳(MCE)荧光信号的仿真分析，寻找适合于MCE荧光信号去噪的小波基函数与去噪阈值。仿真研究的结果表明：选择sym7小波基函数、分解层数(lev=5)与使用Heuristic软阈值，可以有效地去除MCE荧光光谱信号的噪声，提高信号的信噪比；处理后，信号的峰位置准确、峰高误差小，可以提高分析的准确度。