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传统经典的分离培养和显微技术以其简便易行的特点仍然在被继续使用,但是由于特定生境中大多数微生物处于"存活但不能培养"状态,所以对于好氧堆肥这样一个微生态中的微生物进行研究时,就不得不要用现代的研究方法,即现代生物化学方法和分子生物学方法.本文分别回顾评述了醌类分析、磷脂脂肪酸分析和ATP分析这三类现代生物化学方法和16SrRNA和18SrRNA基因序列分析、16S-23SrDNA转录间隔区序列分析、聚丙烯酰胺凝胶电泳和DNA微集阵列(DNA microarrays这四类现代分子生物学方法,应用于好氧堆肥过程中的微生物的研究现状.最后进行了一些合理的展望.