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采用EPA1623法(免疫磁分离及荧光染色法)对上海市几家典型的自来水厂的水源水、出厂水、管道水贾第鞭毛虫和隐孢子虫的分布状况进行了测定分析,并对水厂净水过程中不同操作单元对两虫的去除效果进行了研究。研究表明:上海浦东自来水厂水源水中存在贾第鞭毛虫与隐孢子虫,但其密度分别维持在0-8个/10L的低水平,而出厂水与管道水中均未检出两虫；水厂净水过程中,混凝沉淀对两虫具有明显的去除效果。