盐生植物辽宁碱蓬转录组测序及分析

来源 :2012全国植物生物学大会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:bailiankk
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  辽宁碱蓬(Suaeda liaotungensis Kitag)属于藜科(Chenopodiaceae)碱蓬属(Suaeda),生长在渤海湾沿岸盐碱滩上,可以在水质含盐量为3%的盐土上正常开花结实,是一种耐盐性很强的盐生植物,是一个天然的耐盐基因资源库,是研究植物耐盐机理的好材料。我们对野生条件下生长的辽宁碱蓬进行了全株转录组测序,并对所获得的序列进行了生物学信息分析。经Solexa测序,获得reads(>l00 bp)39,724,714条;经拼接获得Contigs (>lOObp) 82,078个;对非冗余蛋白数据库进行Blastx比对和功能注释,获得Unigene 17,976个,发现了耐盐相关基因11个,各类转录因子多个,其中NAC类20个,MYB类15个,WRKY类14个,EREBP类3个,MYC类2个,DREB类2个,GT因子2个。这些数据为研究盐生植物的耐盐机制、获得新的耐盐基因奠定了基础。
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