LC-MS/MS法对融合蛋白FP3的氨基酸全序列测定

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目的:运用液质联用,两种串联质谱对融合蛋白FP3的氨基酸全序列测定,确证其一级结构。方法:通过胰蛋白酶酶解蛋白,PNGase F去除多肽混合物中糖肽的糖基化,将去糖后的总肽用于液质联用系统,通过液相分离后,运用Q-TOF和线性离子阱两种串联质谱测定各个肽段的b,y碎片离子,分析测定融合蛋白FP3的氨基酸全序列。结果:通过LC-ESI-Q-TOF完成了融合蛋白FP3的76%氨基酸序列测定,通过LC-ESI-Trap完成余下24%氨基酸序列测定。结论:液质联用,串联质谱法测定蛋白质氨基酸序列快速,灵敏,准确,是对重组蛋白结构分析和确证的重要手段。
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