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受体和配体如何识别及其具体的识别机制一直是一个具有争论性的课题。为了详细解释分子识别机制，我们选择一个合成受体及其配体作为研究体系，采用ABEEMσπ/MM浮动电荷力场方法进行分子动力学计算，来模拟受体和配体的识别过程。在模拟过程中发现，配体C端的羧基与N端的氨基形成了一个盐桥，这个盐桥就像一个启动的开关，发出了极化信号，从而激活了受体和配体的识别过程。开关一旦关闭即从两根平行氢键的状态转变成分义形的由一个氢原子与两个羧基中的氧原子形成的氢键状态，作为配体活性中心的精氨酸侧链便从伸展状态变成收缩状态，同时与胍基形成氢键的水分子也随着一起被拉向配体，而水分子的另一端也与受体中的活性中心磷酸根离子形成氢键，这样在开关关闭同时受体也向配体靠近。