基于GWAS和eQTL挖掘油菜含油量相关的转录因子及其调控网络

被引量 : 0次 | 上传用户:jimzhan
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
甘蓝型油菜(Brassica napus,AACC,2n=38,以下简称油菜)是我国重要的油料作物,系统研究油菜种子发育过程中的脂质代谢相关基因的表达调控及其与表型之间的联系,对于揭示菜籽油分形成和积累的调控关系非常关键。为了挖掘甘蓝型油菜含油量相关的转录因子(TF),揭示油脂合成相关基因的转录调控机制,我们通过对505份油菜种子含油量进行GWAS分析,鉴定出了380个与含油量显著相关的SNP。同时我们利用上述群体中309份材料的基因表达数据和基因型数据,鉴定出107个eQTL热点区域,并发现eQTL热点中TF显著富集,表明eQTL热点中可能存在与脂肪酸代谢相关的TF。通过整合油菜GWAS和eQTL数据和拟南芥脂类代谢网络等多组学信息,本研究鉴定了甘蓝型油菜种子含油量相关的转录因子并构建其调控网络。其中16个转录因子同时存在与含油量性状和脂类代谢基因显著关联的SNP位点,并且大部分转录因子都具有一因多效(调控多个含油量相关基因)。
其他文献
目的:探讨硬膜外利多卡因复合芬太尼在剖宫产手术时的效果及安全性。方法:硬膜外注入试验剂量2%利多卡因首剂量5ml,每首剂量5ml隔3min硬膜外导管追加2%利多卡因5ml,达无痛效果。结
旅游合同示范文本由旅游局和工商局联合制定推广,性质上属行政指导,具有效率、安全、优先及补充等法律价值,示范文本条款分四大功能模块,由通用条款和协议条款组成。目前示范
针对广州地铁3号线北延段刚性接触网下120 km/h地铁列车弓网连续燃弧问题,分析了燃弧产生原因,建立弓网系统仿真模型,从受电弓、接触网两方面进行仿真计算,提出适合120 km/h
<正>重点高中凭什么吸引孩子?无非是名牌大学在召唤。那中职学校如何吸引孩子呢?当然是让他对所学专业产生兴趣。那么,什么专业才能让他有兴趣呢?关键是看如何引导。由于学生
针对智能变电站不同于常规变电站检修机制的特点,阐述了检修机制的基本要求和分类,详细分析了智能电子设备检修机制的单体测试、整组测试、单间隔测试和跨间隔测试内容及注意
结合工程实例论述1000MW级火力发电厂烟气采用湿法脱硫,脱硫系统在不设置GGH装置条件下,烟囱内筒所受烟气腐蚀特性及烟囱设计选型要点。经过技术、经济比较后,推荐新建大型火
天空的开阔性容得下神明,也容得下常人;星空的神秘既可让人膜拜,也可以引人向上生长;天空浩瀚无际变化多端的深远,令人超越庸常生命境界;人可以平视天空,与天空对话;天空无所
综述了氧化钕的生产、应用及市场。内容包括氧化钕的生产原料、工艺技术及装备,生产能力与产量、产品应用和市场。
目的分析避免化疗病人血管损伤和药物外渗的护理。方法以我院于2017年11月至2018年7月收治的37例化疗患者为研究对象。给予患者血管选择护理、穿刺护理、给药护理及健康教育
随着经济的发展,城市建设不断推进。沿海城市面对扩张中越来越突显出土地资源的紧张,采取围海造陆这一办法来解决。近年来,国内外学者就针对这一问题做出大量研究,对海涂开发