论文部分内容阅读
本文本文在Gaussian09 量子化学软件和GaussView5.0 可视化软件中应用B3LYP/6-311++G(d,p)方法对甘氨酸及苏氨酸二肽、三肽分子结构优化,并以从头算B3LYP/6-311++G(d,p)方法计算的稳定构象为基准,应用浮动电荷极化力场ABEEMσπ/MM[1-3] 可以获得与高水平从头算B3LYP 相同数量的对应二肽、三肽的稳定构象,而且算得的甘氨酸和苏氨酸二肽、三肽的骨架二面角的平均绝对偏差MAD 和均方根偏差RMSD都很小.