【摘 要】
:
利用MISA软件对短丝木犀花和叶芽转录组测序得到的92798条unigenes进行SSR位点查找和分析,共搜索到11881个SSR位点,除单碱基重复外,SSR出现频率为4.64%,分布密度为1/15.02kb.
【机 构】
:
南京林业大学南方现代林业协同创新中心,江苏 南京 210037
【出 处】
:
中国园艺学会全国花卉资源、育种、栽培及应用技术交流会
论文部分内容阅读
利用MISA软件对短丝木犀花和叶芽转录组测序得到的92798条unigenes进行SSR位点查找和分析,共搜索到11881个SSR位点,除单碱基重复外,SSR出现频率为4.64%,分布密度为1/15.02kb.二碱基和三碱基重复为短丝木犀SSR主要重复单元类型,分布占SSR总数的66.35%和30.42%.其中AG/CT和AAG/CTT分别为二碱基和三碱基重复单元的优势重复基元,分别占各自重复单元的63.21%、30.38%.短丝木犀SSR多为重复长度小于20bp的短序列,长度大于20bp的SSR仅占总数的13.47%.同时发现短丝木犀SSR的频率和长度呈显著负相关(P<0.01),相关系数为-0.408.另外,设计筛选得到2435对SSR引物.短丝木犀转录组SSR位点出现频率高,类型丰富、多态性潜能较高.
其他文献
一、生态文明建设,是落实科学发展观的重要标志,是建设资源节约型和环境友好型社会的必然选择胡锦涛总书记在党的十七大报告中,提出了实现全面建设小康社会奋斗目标的新要求,
柿树是易县的主要果树,现有23万株,其中结果树14万株,幼树9万株。柿树在我县栽培历史悠久,分布广泛,果实营养丰富,具有多种用途,是山区人民喜欢的“铁杆庄稼”。过去由于放任
本杰明·兰姆写道:普通公民担任质疑舆论的古代戏剧大奖的评委,他们奖励敏锐与智慧。这一尝试不仅影响了戏剧,而且影响了民主本身。“通俗文化是一个用词自相矛盾的说法,”时
开展种间远缘杂交研究,必须做大量检定染色体的细胞学工作,而检定红麻染色体的关键,在于在显微镜下能找到大量清晰、分散好的体细胞染色体中期分裂相,这样才易于快速而准确地
白内障是人类第一大致盲眼病,其中以老年性白内障居多。该病迄今原因未明,现认为是多种因素综合作用的结果,如老年性白内障。致病因素主要有:氧化应激;日光照射和紫外线辐射;
阳光、沙滩、世界小姐、“美丽外交”……这些词儿让人对海天一色的南海明珠产生无限的遐想。每天,从韩国和俄罗斯飞抵三亚的国际航班都会带来大量慕名而来的游客。他们经过
(一)重庆是一座特殊的城市:8.2万平方公里、3100万人,大城市与大农村并存,既有经济社会发展水平不逊于东部沿海地区的都市景象的主城区,也有国家级贫困县的落后与抗争。城乡
编辑同志:我大学毕业一年了,渐渐染上了多吃少动的“社会病”。最近一个月,吃油腻食物特别多,经常闹便秘,隔几天都不拉,怎么办?四川杨×杨读者:便秘本是老年人常见的毛病,现
“飞地经济”在资源配置上,不但突破了两地之间的空间距离,也突破了两地之间的某些制度性、体制性障碍,是充分发挥两地资源优势,促进共同发展的一种有效模式。上个世纪末,国
人类语言的进化挺有意思,就汉语而言,我们觉得“之乎者也”的文言文难懂,时下的年轻人又嫌白话文太乏味,贴在网上很土很无趣。于是,他们创造了“囧”“浮云”“给力”等新鲜