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自交不亲和性是许多显花植物具有的识别自体和异体花粉的一种遗传机制，受控于由复等位基因构成的单一遗传转位点，称为Ｓ位点。在以茄科等为代表的配子体自交不亲和植物中，Ｓ位点编码一类核酸酶即Ｓ核酸酶控制雌性生殖组织（花柱）对自体和异体花粉的识别。虽然目前对Ｓ核酸酶如何抑制自体花粉的分子机理还不是十分清楚，但是Ｓ位点可能编码一种花粉表达的Ｓ核酸酶抑制因子与Ｓ核酸酶进行等位基因特异的相互作用，实现花柱对自体和异体花粉的识别。