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水稻细菌性条斑病菌(Xoc)是稻黄单胞菌下的致病变种之一，引起的水稻细菌性条斑病菌。虽然Xoc与白叶枯病菌(Xoo)在生物学、遗传学和生化特征上有高度的相似性，但水稻抗BLS的关系还没有像水稻抗白叶枯病那样清晰，并且Xoc与水稻互作中不存在明显的“基因-基因”关系，因此有关中国水稻条斑病菌致病型和基因型的多样性的了解，对于监控Xoc的毒性组成、抗性水稻品种的利用与布局，具有重要的理论和实践意义。基因组学分析显示，Xoc与Xoo与水稻互作，除了胞外水解酶类和胞外多糖等相关基因有差异外，主要差异成分表现在avrBs3/pthA基因家族上。本研究利用avrBs3/pthA家族基因为探针，对2007～2009年从我国南方稻区收集的71株Xoc代表性菌株进行了遗传学分析。Southem杂交结果显示以下规律：中国Xoc菌系分为14个基因型，其中基因型8和基因型10在我国南方稻区均有分布，是主要的优势菌系；我国各水稻产区Xoc优势菌系间，avrBs3/pthA基因数量差异不大，含有tale基因数量均超过20个；我国Xoc菌系基因型的差异主要表现在毗邻核酸内切酶V和Rhs元件位点的tale基因上；我国云南和四川的Xoc菌系在tale基因上遗传多样性更为丰富，tale基因数量从少到多的趋势明显。为了揭示Xoc与水稻互作的基因对基因关系，采用苗期注射和成株期针刺接种两种方法，在23个抗BB的水稻近等基因系上进行抗病性分析。结果表示：在DV85水稻上除GXB3-11菌株显示基因-对-基因关系外，大多数菌株并不与水稻显示“基因-基因”关系；tale基因数量越多，在水稻上的毒性越强，反之也然；中国Xoc菌系在水稻上的毒性虽有分化，但水稻表现的抗、感性差异并不显著；中国Xoc菌系的tale数量少于菲律宾来源的BLS256和BLS303菌株，因严格检疫南亚国家来源的水稻材料，科研部门应严格禁用国外来源的Xoc菌株，防止可能毒性更强的Xoc的传入。为了有效检测Xoc的不同菌系，本研究利用核酸内切酶V位点，建立了PCR检测技术，可根据AFLP条带大小，分析不同菌株携带tale基因的数量变化。