rpoB基因在不动杆菌属菌种鉴定中的应用

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目的:不动杆菌属的菌种鉴定是目前临床鉴定一个难点,通过比较不动杆菌属菌种鉴定的不同方法,探讨rpoB基因对不动杆菌属各菌种的鉴定价值。方法:从全国23个省收集经VITEK细菌生化鉴定为不动杆菌属细菌共计416株,分别通过对16SrRNA基因及rpoB基因进行PCR扩增及测序分析,并结合系统生物学分析方法对16SrRNA基因及rpoB基因的序列构建系统进化树;通过比较分析,探讨传统生化鉴定方法、16SrRNA基因序列及rpoB基因序列对实验菌株菌种鉴定的准确性。结果:经典的生化鉴定方法可以将416株不动杆菌属细菌分为醋酸钙-鲍曼复合体(364株)、洛菲不动杆菌(30株)、溶血不动杆菌(4株)及琼氏不动杆菌(18株)等有限的几个种,而不能区分出其他的种,更无法将醋酸钙-鲍曼复合体进一步分开。16SrRNA序列系统生成树能将416株细菌分成8个簇,经过网上比对为醋酸钙不动杆菌(170株)、琼氏不动杆菌(23株)baylyi不动杆菌(10株)、鲍曼不动杆菌(13株),其余各簇网上比对只能确定为不动杆菌属,无法确认为具体哪种不动杆菌。rpoB基因序列生成树分成9个大簇,网上比对后鲍曼不动杆菌(20株),该簇细菌blaOXA-51均阳性,nosocomialis不动杆菌(38株),琼氏不动杆菌(23株),baylyi不动杆菌(10株),洛菲不动杆菌(10株),溶血不动杆菌(2株),乌尔辛不动杆菌(1株),parvus不动杆菌(2株),bereziniae不动杆菌(4株)。其余为醋酸钙不动杆菌,但是由于基因库的醋酸钙不动杆菌基因组本身差异很大,因此在rpoB进化树上分布于不同簇上。结论:通过rpoB基因扩增及测序,能更有效将临床不动杆菌属的不同种精确区分,在临床中有非常实用的价值。
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