灭活溶藻弧菌适配子的SELEX筛选研究

来源 :2012年中国水产学会学术年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:coconutt
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  利用SELEX技术筛选到的适配子已经成功应用于人类药物筛选和疾病治疗,但在水产中的应用还处于起步阶段.本研究以灭活的溶藻弧菌(Vibrioalginolyticus)为靶目标,利用SELEX技术,经过15轮的筛选,其中每隔3轮分别用迟钝爱德华氏菌(Edwardsiella tarda)、嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila)、哈维氏弧菌(Vibrio harveyi)进行反筛.随后进行了ssDNA富集文库与灭活溶藻弧菌的亲和力、亲和常数的测定.将最后一轮的PCR产物送上海美吉生物医药科技有限公司进行克隆测序,测序结果用DNAMAN和RNAstructure5.3分别进行一级和二级结构分析.研究结果表明:经过15轮筛选,随机ssDNA文库与灭活溶藻弧菌的亲和力从0.02507上升至0.4516,上升了18倍; 15轮随机ssDNA富集文库的亲和常数为:Kd=27.5±9.2nM.根据软件分析,我们将克隆测序的53条序列去重后整理成32条,并按一级结构将其分成9个家族,其中的8个有共同的保守序列.这32条序列中有6条序列具有较高的重复率,我们初步认为其具有进一步研究的价值.
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