染色质构象捕获(Chromosome conformation capture,3C)是检测基因组内染色质间相互作用的一种方法.主要通过染色质的甲醛交联,限制性酶切消化,并以DNA片段共价连接的方式,重新连接形成新的连接产物,用生物素标记的核苷酸连接在接口处,使带有生物素标记的核苷酸的连接接口可被选择性纯化,进行扩增检测.因此，对于研究3D核型空间模式的调控及远距离调控机制，必须弄清楚一个具有高稳定性和通用性的高级染色质构象实验的方法。但是，以上这些方法仍然有其制约性，不能提供染色质相互关系的一个整体基因组观查。如何以一个新的较高效率的方法研究染色质相互作用，低噪声，广泛的基因组等仍然是一个问题。在未来一段时间内，会有更多的以3C为基础的新的实验方法。以期能像荧光染色体原位杂交技术一样，能提供一个更独立的分析结果，为染色体相互作用提供一个更直接更真实的证据。