【摘 要】
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从大熊猫全基因组中搜索微卫星序列,分析了各种微卫星数量及分布规律,并从中筛选出54个全新的、具有多态性的大熊猫四碱基微卫星座位.用大熊猫粪便提取的DNA为材料,进一
【机 构】
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四川大学生命科学学院,成都610064
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从大熊猫全基因组中搜索微卫星序列,分析了各种微卫星数量及分布规律,并从中筛选出54个全新的、具有多态性的大熊猫四碱基微卫星座位.用大熊猫粪便提取的DNA为材料,进一步筛选扩增稳定、不易出现基因分型错误、且具有良好多态性的微卫星标记15个.这15个座位遵从中性突变模式,符合哈德温格平衡(P＞0.01),等位基因数的范围是3-8,平均值是4.53,观察杂合度(H0)的变异范围是0.367-0.800；期望杂合度(He)的变异范围是0.455-0.808.多态信息含量(PIC)的变异范围是0.369-0.761,平均值是0.554,PIC＞0.5,说明本研究所选用的座位具有较高的多态性,为建立大熊猫标准化微卫星标记方法奠定了基础.应用筛选出的15个微卫星标记,建立了142只圈养大熊猫的微卫星数据库,在模拟计算的基础上,建立了大熊猫个体识别、亲子鉴定和种群遗传多样性评估标准化方法,并在实践中得到验证和应用.应用微卫星数据库数据,比较分析了大熊猫卧龙野生种群和三个圈养种群的遗传结构和遗传多样性,发现圈养大熊猫幼年组部分等位基因频率明显下降,模拟结果显示,在缺乏基因交流的情况下,三个圈养种群的遗传多样性在未来20代将会出现明显降低,并提出了相应的保护管理建议.
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