鸡脾脏ROBO2基因表达的基因组关联分析

来源 :中国畜牧兽医学会家禽学分会第十七次全国家禽学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:weiandlu
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
新城疫是威胁中国养禽业的“一类动物疫病”,现主要以生物安全管理和免疫接种加以控制,因此对其开展免疫应答基础研究具有重要现实意义.Luo等(2013)通过全基因组关联分析策略已经发现了影响鸡新城疫病毒抗体水平的重要基因组区域,其中ROBO2基因是重要的候选基因.前期研究已表明ROBO2基因与神经系统发育有密切关系,但是否与机体免疫应答有关则研究较少,或许可以通过影响它表达的基因加以分析,因此本研究对鸡脾脏ROBO2基因表达进行了基因组关联分析.本研究表明鸡基因组中确实存在影响脾脏ROBO2基因表达的变异区域,而这些区域内也存在不少与神经发育或免疫应答相关的功能基因。从而可推测ROBO2基因不仅影响着神经发育,而且也应该与免疫应答有密切联系。
其他文献
NLRC5基因在本实验室广西黄鸡感染白痢沙门氏菌后脾脏组织的时序表达谱中是差异表达基因,通过分析表达谱数据,可以为提供了一个很好的基于数据驱动的方法来尝试分析该基因的共表达网络,以及可能的调控机理.重点研究了NLRC5基因同其他差异表达基因间的互信息相关性,尝试找到一些具有共表达特征的基因.
为了研究NLRC5基因启动子区的SNP及其对启动子功能元件的影响,采用目标捕获测序和PCR产物直接测序的方法对27个鸡品种和2种细胞的NLRC5基因启动子区进行SNP检测,总共检测到37个SNP位点,其中斗鸡未发现SNP存在,SNP9存在于除斗鸡以外的其它鸡种和细胞.生物信息学软件预测得到NLRC5基因启动子区转录因子结合位点和CpG岛,SNP位点对转录因子结合位点和CpG岛大小均有影响,表明NL
蛋壳虽然是鸡蛋产品中的非食用部分,但其品质对蛋鸡产业经济的重要意义,以及其结构对生物矿化和材料科学研究的价值,使得对其超微结构的研究一直是学者关注的热点。本文首次使用全基因组的SNP数据估计了蛋壳4个主要超微结构性状的遗传力,并描述了性状在群体中的分布规律以及性状间的关系。试验的群体规模较大,使得本文的结果能够反映蛋壳超微结构性状在群体中的一般分布规律和遗传特点。本试验所用群体以及构建此群体的两个
GH基因是生长轴中的重要组成部分之一,对长寿小鼠生长激素调控通路的研究表明,生长轴中基因表达量的下降与长寿机制有关.GH基因由5个或6个外显子和4个或5个内含子组成的,cDNA长度为800~1200bp.对不同物种GH基因的克隆分析表明,两端侧翼区和外显子区域高度保守,而内含子区域存在较大的变异,这些变异都可能与GH基因的表达调控有关.大量研究表明内含子1对基因的表达调控具有重要影响,内含子1的剪
硫酸乙酰肝素蛋白聚糖(HSPGs)是一类糖复合物,位于细胞外基质和细胞表面,能参与多种生命活动的调控,在生长、发育、能量代谢等不同的生理过程中有着重要的作用.硫酸乙酰肝素糖链的功能主要取决于它与蛋白质、糖类物质等功能性分子的相互作用,而糖链的硫酸化和去硫酸化模式与这些作用密切相关.修饰糖链去硫酸化作用的主要是硫酸酯酶酶(Sulfs),成员包括硫酸酯酶1(Sulf1)和硫酸酯酶2(Sulf2).它们
动物的攻击行为(Aggressive Behavior)是指同种动物个体之间因争夺食物、配偶等有利于个体生存条件而发生的相互斗争行为,其为受多因子影响的一类竞争空间行为(spacingbehavior).在生产中,减少家鸡的攻击行为,有利于提高饲料转化率和降低个体死亡率,改善鸡只体型,从而增加企业的经济效益.攻击行为受遗传与环境共同影响,在家禽中,攻击行为的研究主要集中于生产方面的研究(光照、声音
FOXL2(Forkhead Transcription Factor)是FOX转录因子超家族的成员之一,是最早发现的哺乳动物卵巢分化标记,参与卵巢发育及卵巢细胞生长和增殖.人类临床中发现FOXL2突变可造成卵巢早衰(POF)和雌性不育,并且在小鼠中敲除FOXL2可造成成年小鼠的XX性反转现象.FOXL2在小鼠卵巢中的表达从胚胎期一直持续到成年期,并且在成熟卵巢的初级和次级卵泡颗粒细胞中表达.近年
初生雏鸡的雌雄鉴别在养鸡业中有着重要的意义.在众多的鉴别方法中,金银羽自别雌雄有鉴别速度快、准确率高、不需要对鉴别人员进行较多的技术培训、对雏鸡损伤小、交叉感染疾病的可能性小、简单直观、没有时间的限制等优点.Ulrika Gunnarsson等(2007)的研究表明,SLC45A2基因的两个错义突变(Tyr277Cys及Leu347Met)与银羽等位基因有关.本研究利用PCR-PAGE技术对Leu
NOD1是天然免疫胞内模式识别受体NLR家族的一个重要成员.其在先天性免疫反应中参与炎症反应和细胞凋亡过程,也与一些炎症性疾病的发生有关.但目前在禽类中相关研究报道较少,本文采用荧光定量的方法,检测了NOD1基因在不同发育时期AA肉鸡几种免疫器官中的表达量,分析NOD1基因的表达特性,为NOD1基因的在鸡体免疫系统中的功能研究奠定理论基础.NOD1基因在鸡的几个免疫组织的不同发育阶段均有表达,且鸡
固醇调控元件结合转录因子1(SREBF1)是脂质代谢中非常重要的一个信号转导因子,其靶基因众多,涉及到胆固醇合成、LDL摄取、脂肪酸合成和去饱和、甘油三酯合成等重要生理过程.本研究克隆获得了大恒优质肉鸡SREBF1基因的全编码区序列,并翻译获得其氨基酸序列(1115aa).通过生物信息学分析表明:SREBP-1蛋白不是跨膜蛋白,但存在跨膜区,具有bHLH转录因子家族典型的保守结构功能域,说明了SR