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单位面积有效穗数（PSN）是小麦产量的重要构成因素。为了探究其遗传基础,我们利用在正常播量条件下有效穗数存在显著差异的2个小麦品系高5 （亩成穗25-30万）和农大5224 （亩成穗50-55万）构建了包含349个F2:3家系和186个重组自交系的分离群体,对有效穗数进行QTL分析。利用遗传模型预测软件SEA1.0版本对3个环境中F2:3家系的表型数据分析发现,该性状符合1MG-AD （E2）或2MG-AD （E1,E3）模型。因此,采用BSA策略,利用小麦90K和660K芯片对极端个体的DNA混池分析发现,差异SNP主要集中在4BS上。在此基础上,利用参考基因组中国春的序列信息,开发多态性标记,将控制该性状的QTL （QPsn.cau-4B）初步定位在4BS的24.91-46.23Mb区段。之后,利用90K芯片对重组自交系群体进行了基因分型,构建了高密度遗传连锁图谱。对重组自交系群体进行QTL分析发现,在3个环境下均检测到1个稳定的控制有效穗数的QTL,位于4BS上28.71-31.87Mb的物理区间内,能够解释36.05%-55.63%的表型变异,进一步验证了BSA的定位结果。上述实验结果表明,在研究数量性状时,可首先预测目标性状的遗传模型,如果存在主效基因,可直接利用BSA策略开展QTL定位。