肉鸡生长是影响中国肉鸡产业高效生产乃至国计民生的重要经济性状,同时也是肉鸡育种的主要选择目标之一.胃肠道作为动物消化吸收的重要场所,对肉鸡生长调控至关重要.近年来研究表明,机体肠道菌群与宿主之间存在着复杂而微妙的共生关系,与宿主具有共生关系的肠道微生物与宿主生长、免疫反应等具有非常密切的关系,但宿主-肠道微生物互作的特点和规律尚不清楚.本试验运用宏基因组技术研究高低体重肉鸡的肠道微生物区系变化规律.肉鸡不同肠道部位的微生物多样性不同。本试验通过比较十二指肠和盲肠相比，盲肠微生物多样性较高。研究表明，肠道微生物在畜禽生长过程中充当重要的角色。Zhu等（2002）对不同日龄鸡盲肠微生物进行了研究，该结果表明随着鸡肠道成熟化，肠道菌群从单一化的构成向复杂多样性逐渐演化（Zhu et al.,2002）。本试验通过宏基因组方法发现F2 代高体重肉鸡肠道微生物Lactobacillus等有益菌丰度高于低体重肉鸡，该结果提示上述益生菌可能在肉鸡营养消化吸收、抵抗病院微生物感染方面发挥作用，进而影响肉鸡生长。通过本试验研究将对动物宿主与肠道微生物共生共代谢特点和规律研究提供基本参考。