哈克尼西棉胞质不育系花粉败育及育性恢复的转录组表达谱分析

来源 :中国棉花学会2014年年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:sumriver
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  哈克尼西棉胞质胞质不育系已经实现三系配套,并在生产上获得应用,然而其CMS败育及育性恢复的分子机理尚不清楚.为研究哈克尼西棉CMS花粉败育及其育性恢复相关的基因及调控途径,我们利用新一代测序技术(RNA-Seq)分析了哈克尼西棉胞质CMS (588A)及其同型恢复系588R、保持系588 3 ~5 d幼蕾中基因表达水平的差异.共获得80811676条序列,组装后获得平均长度为698 bp的unigene序列89939条,其中约72.62%的unigene可以在蛋白数据库中比对到序列信息.进一步分析发现,与花粉败育有关的差异表达基因有368个,大多在588A中下调表达,这些基因多参与细胞组分形态发生、外部封装结构组织、花粉发育等生物进程,调控花药绒毡层发育的关键基因AMS、MS1、MS2、A6、Chalcone synthase、Cytochrome P450、Alcohol deh ydrogenase、Galactosyltrans erase、Multicopper oxidase、Gl ycosyl trans erase等均在588A中较大程度的下调或沉默表达;与育性恢复有关的差异表达基因有204个,主要参与化学信号响应、氧化还原等进程,588R/588A与588R/588表达模式相同的基因有176个,且以上调表达基因居多.本研究首次利用RNASeq高通量技术在转录组水平研究哈克尼西棉CMS花粉败育及育性恢复的关键基因,发现了许多CMS中下调表达的绒毡层发育基因,说明绒毡层发育异常可能是CMS花粉败育的原因之一;大部分在588R中特异或沉默表达的基因在蛋白数据库中检索不到信息,对这些基因的解析尚需进一步的研究.
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