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基于多目标决策灰色关联投影法建立灰色关联投影模型,进行灰色多目标决策,运用AHP法建立层次结构模型,确定各评价指标初始权重。以长江三角洲经济带典型大型城市-南京市为例,对南京市典型水库进行评价分析,得到水质主要影响指标权重:氨氮＞总磷＞化学需氧量＞高锰酸盐指数＞水温,典型水库水质:理想水库＞金牛山水库＞大泉水库＞方便水库＞姚家水库＞中山水库＞卧龙水库＞河王坝水库＞山湖水库＞老鸦坝水库＞大河桥水库＞赭山头水库＞无想寺水库＞赵村水库＞龙墩河水库＞三岔水库＞安基山水库。研究结果将对于南京市水环境管理具有指导意义。