目的:比较同一病证(红蝴蝶疮SLE)不同证型患者的尿液代谢物差异，从小分子代谢物水平探讨“同病异治”的客观物质基础及其病证相关性，为同病异治提供客观依据。 方法:采用“病证结合”方法，选取阴虚内热型和脾肾阳虚型SLE各30例分别作为实验观察1组和2组，健康志愿者15例作为正常对照组。收集清晨尿液一次，制备样品。应用基于GC-MS技术的代谢组学方法，对各组尿液样品进行代谢产物检测，用偏最小二乘法一判别分析(partialleast square discriminant analysis，PLS-DA)进行数据处理，分别获得各观察组与正常组对比后的样品分类信息和差异变量。将上述差异变量进行组间对照，得到与“病”、“证”所对应的共有和特有的差异变量，在NIST谱库和标准品库中比对检索，鉴定其特征代谢物。 结果:SLE组和正常组在代谢物组方面存在差异，代谢组学可以将两组良好区分，获得128个有显著性差异的潜在特征代谢物(P<0.01或P<0.05)。阴虚内热型、脾肾阳虚型SLE组与正常对照组在代谢物组方面存在差异，代谢组学可以将三组良好区分。发现阴虚内热型和脾肾阳虚型SLE组共有72个相同的潜在特征代谢物，而不同的特征代谢物共有90个，其中阴虚内热型组25个，脾肾阳虚型组65个。证实了阴虚内热型和脾肾阳虚型SLE“病”的发生与三羧酸循环、氨基酸代谢、肠道菌群等的异常相关。 结论:中医“同病异治”理论具有客观物质基础。风湿病“同病异治”中，“病”和“证”的物质基础的多少是不同的。