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草鱼(Ctenopharyngodon idellus)是典型的草食性鱼类，具有生长速度快，肉味鲜美等优点，因而成为重要的经济鱼类.2015年我国草鱼养殖产量是567万吨，是我国第一大水产养殖品种，占我国鱼类养殖产量的20％.自然界中，草鱼以水草为食，水草主要成分是纤维素，但是对草鱼基因组的研究发现，草鱼基因组中没有降解纤维素的酶类.因而，草鱼降解植物性食物的机制引起了广泛的关注.动物的消化道内存在着大量的微生物.近年来的研究发现，在动物的长期进化过程中，消化道微生物与宿主协同进化而具有许多重要功能.因此，消化道微可能在草鱼利用植物性食物的过程中起涨重要作用.