水质基准是基于科学实验和推论得出的结果，是对水体中的污染物或其他有害因素阈值的限定，为水质标准的制修订和环境管理提供科学依据，是环保部门制定水质标准、评价水质和进行水质管理不可或缺的科学依据和理论基础，在水体环境保护方面发挥着重要作用。水质基准的研究工作，将会在我国环境标准体系的建立和完善、以及提升我国在环境科学领域的研究和管理水平方面发挥重要作用。水生态区是指具有单一功能、包括多种生态系统的大型地理区域。对一个生物区系无害的毒物浓度，也许会对其他区系的生物产生不可逆转的毒性效应。所以，同一污染物的针对不同保护对象的基准值也存在一定差异。生态分区之间的生物群落结构存在较大的差异，不同生态分区的水质基准也会存在差异。已有研究表明，不同区域由于自然环境、生物结构、地理特征等多种因素的影响，导致其水质基准存在差异。我们的研究表明，不同水生态分区中的水质及生物的差异性明显，气候、水文水动力过程、流域下垫面等自然因素以及土地利用、社会经济条件等人为指标都会对其产生显著影响。